动态规划-最长公共子序列问题(LCS)

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若给定序列X={x1,x2,…,xm},则另一序列Z={z1,z2,…,zk} 是X的子序列 是指存在一个严格递增下标序列{i1,i2,…,ik}使得对于所有j=1,2,…,k有:zj=xij。

例如,序列Z={B,C,D,B}是序列X={A,B,C,B,D,A,B}的子序列,相应的递增下标序列为{2,3,5,7}。

给定2个序列XY,当另一序列Z既是X的子序列又是Y的子序列时,称Z是序列XY公共子序列

例如,序列X={ABCBDAB}Y={BDCABA}的子序列,{BCA}XY的公共子序列,但不是最长公共子序列;{BCBA}也是XY的公共子序列,但它是XY的最长公共子序列,因为XY没有长度大于4的公共子序列。

给定2个序列X={x1,x2,…,xm}Y={y1,y2,…,yn},找出XY的最长公共子序列。

输入:序列X的长度m,序列Y的长度n;序列X各个元素,序列Y各个元素

输出:X与Y的最长公共子序列,最长公共子序列的长度。

运行结果:

解法一:穷举法,列举出X所有可能的子序列,并检查它是否也是Y的子序列,从而确定它是否为公共子序列,在此过程中记录最长的公共子序列

算法复杂度分析: 2X中任意取l个元素构成子序列,共有2m种不同子集。     

解法二:尝试用动态规划求解

最长公共子序列结构

设序列X = {x1,x2,...xm}和Y= {y1,y2,...yn}的最长公共子序列为Z = {z1,z2,...zk} 则

(1)若Xm = Yn,Zk = Xm = Yn,且Zk-1是Xm-1和Yn-1的最长公共子序列。

(2)若Xm!=Yn且Zk != Xm,则Z是Xm-1和Y的最长公共子序列。(反证法:Z是Xm-1和Y的公共子序列,但不是最长的)

(3)若Xm!=Yn且Zk !=Yn,则Z是X和Yn-1的最长公共子序列。

2个序列的最长公共子序列包含了它们前缀的最长公共子序列。

最长公共子序列问题有最优子结构性质。

子问题的递归结构

由最优子结构性质建立子问题最优值的递归关系

c[i][j]记录序列XY的最长公共子序列的长度,其中, Xi={x1,x2,…,xi}Yj={y1,y2,…,yj}

i=0j=0时,空序列是XiYj的最长公共子序列。故C[i][j]=0

其他情况下,由最优子结构性质可建立递归关系如下。

三、计算最优值

直接利用递归式的算法是指数时间的,由于在所考虑的子问题空间中,总共有θ(mn)θ是上下界符号)个不同的子问题,因此,用动态规划算法自底向上地计算最优值能提高算法的效率。
b[i][j]记录c[i][j]是由哪个子问题得到的

void LCSLength(int m, int n, char *x, char *y, int c[][maxn], int b[][maxn])
{
    int i, j;

    c[0][0] = 0;
    for(i = 1; i <= m; i++)
        c[i][0] = 0;
    for(j = 1; j <= n; j++)
        c[0][j] = 0;
    for(i = 1; i <= m; i++)
        for(j = 1; j <= n; j++)
        {
            if(x[i]== y[j])
            {
                c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;
                b[i][j] = 1;
            }
            else if(c[i-1][j] >= c[i][j-1])
            {
                c[i][j] = c[i-1][j];
                b[i][j] = 2;
            }
            else
            {
                c[i][j] = c[i][j-1];
                b[i][j] = 3;
            }
        }
}

四、构造最长公共子序列

LCSLength只是计算出最优值,并未给出最优解,然而数组b可用于快速构造两个序列的最长公共子序列:

b[i][j]=1时表示XiYj的最长公共子序列是Xi-1Yj-1的最长公共子序列加上xi所得到()

b[i][j]=2时表示XiYj的最长公共子序列Xi-1Yj的最长公共子序列相同(上)

b[i][j]=3时表示XiYj的最长公共子序列XiYj-1的最长公共子序列相同(左)

根据b的内容打印出最长公共子序列

void LCS(int i, int j, char *x, int b[][maxn])
{
    if(i == 0 || j == 0)
        return;
    if(b[i][j] == 1)
    {
        LCS(i-1, j-1, x, b);
        printf("%c ", x[i]);
    }
    else if(b[i][j] == 2)
        LCS(i-1, j, x, b);
    else
        LCS(i, j-1, x, b);
}

 

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