spark基础之shuffle机制和原理分析

Shuffle就是对数据进行重组,由于分布式计算的特性和要求,在实现细节上更加繁琐和复杂。
在MapReduce框架,Shuffle是连接Map和Reduce之间的桥梁,Map阶段通过shuffle读取数据并输出到对应的Reduce;而Reduce阶段负责从Map端拉取数据并进行计算。在整个shuffle过程中,往往伴随着大量的磁盘和网络I/O。所以shuffle性能的高低也直接决定了整个程序的性能高低。Spark也会有自己的shuffle实现过程。

在DAG调度的过程中,Stage阶段的划分是根据是否有shuffle过程,也就是存在ShuffleDependency宽依赖的时候,需要进行shuffle,这时候会将作业job划分成多个Stage;并且在划分Stage的时候,构建ShuffleDependency的时候进行shuffle注册,获取后续数据读取所需要的ShuffleHandle,最终每一个job提交后都会生成一个ResultStage和若干个ShuffleMapStage,其中ResultStage表示生成作业的最终结果所在的Stage. ResultStage与ShuffleMapStage中的task分别对应着ResultTask与ShuffleMapTask。一个作业,除了最终的ResultStage外,其他若干ShuffleMapStage中各个ShuffleMapTask都需要将最终的数据根据相应的Partitioner对数据进行分组,然后持久化分区的数据。
一 HashShuffle机制
1.1 HashShuffle概述
在spark-1.6版本之前,一直使用HashShuffle,在spark-1.6版本之后使用Sort-Base Shuffle,因为HashShuffle存在的不足所以就替换了HashShuffle.
我们知道,Spark的运行主要分为2部分:一部分是驱动程序,其核心是SparkContext;另一部分是Worker节点上Task,它是运行实际任务的。程序运行的时候,Driver和Executor进程相互交互:运行什么任务,即Driver会分配Task到Executor,Driver 跟 Executor 进行网络传输; 任务数据从哪儿获取,即Task要从 Driver 抓取其他上游的 Task 的数据结果,所以有这个过程中就不断的产生网络结果。其中,下一个 Stage 向上一个 Stage 要数据这个过程,我们就称之为 Shuffle。
1.2 没有优化之前的HashShuffle机制

在HashShuffle没有优化之前,每一个ShufflleMapTask会为每一个ReduceTask创建一个bucket缓存,并且会为每一个bucket创建一个文件。这个bucket存放的数据就是经过Partitioner操作(默认是HashPartitioner)之后找到对应的bucket然后放进去,最后将数据
刷新bucket缓存的数据到磁盘上,即对应的block file.
然后ShuffleMapTask将输出作为MapStatus发送到DAGScheduler的MapOutputTrackerMaster,每一个MapStatus包含了每一个ResultTask要拉取的数据的位置和大小。
ResultTask然后去利用BlockStoreShuffleFetcher向MapOutputTrackerMaster获取MapStatus,看哪一份数据是属于自己的,然后底层通过BlockManager将数据拉取过来

拉取过来的数据会组成一个内部的ShuffleRDD,优先放入内存,内存不够用则放入磁盘,然后ResulTask开始进行聚合,最后生成我们希望获取的那个MapPartitionRDD。
缺点:
如上图所示:在这里有1个worker,2个executor,每一个executor运行2个ShuffleMapTask,有三个ReduceTask,所以总共就有4 * 3=12个bucket和12个block file。

如果数据量较大,将会生成MR个小文件,比如ShuffleMapTask有100个,ResultTask有100个,这就会产生100100=10000个小文件

bucket缓存很重要,需要将ShuffleMapTask所有数据都写入bucket,才会刷到磁盘,那么如果Map端数据过多,这就很容易造成内存溢出,尽管后面有优化,bucket写入的数据达到刷新到磁盘的阀值之后,就会将数据一点一点的刷新到磁盘,但是这样磁盘I/O就多了

1.3 优化后的HashShuffle

每一个Executor进程根据核数,决定Task的并发数量,比如executor核数是2,就是可以并发运行两个task,如果是一个则只能运行一个task
假设executor核数是1,ShuffleMapTask数量是M,那么它依然会根据ResultTask的数量R,创建R个bucket缓存,然后对key进行hash,数据进入不同的bucket中,每一个bucket对应着一个block file,用于刷新bucket缓存里的数据。
然后下一个task运行的时候,那么不会再创建新的bucket和block file,而是复用之前的task已经创建好的bucket和block file。即所谓同一个Executor进程里所有Task都会把相同的key放入相同的bucket缓冲区中

这样的话,生成文件的数量就是(本地worker的executor数量executor的coresResultTask数量)如上图所示,即2 * 1* 3 = 6个文件,每一个Executor的shuffleMapTask数量100,ReduceTask数量为100,那么未优化的HashShuffle的文件数是2 1 100100 =20000,优化之后的数量是21*100 = 200文件,相当于少了100倍。
缺点:如果 Reducer 端的并行任务或者是数据分片过多的话则 Core * Reducer Task 依旧过大,也会产生很多小文件。
二 Sort-Based Shuffle
2.1 Sort-Based Shuffle概述
HashShuffle回顾
HashShuffle写数据的时候,内存有一个bucket缓冲区,同时在本地磁盘有对应的本地文件,如果本地有文件,那么在内存应该也有文件句柄也是需要耗费内存的。也就是说,从内存的角度考虑,即有一部分存储数据,一部分管理文件句柄。如果Mapper分片数量为1000,Reduce分片数量为1000,那么总共就需要1000000个小文件。所以就会有很多内存消耗,频繁IO以及GC频繁或者出现内存溢出。
而且Reducer端读取Map端数据时,Mapper有这么多小文件,就需要打开很多网络通道读取,很容易造成Reducer(下一个stage)通过driver去拉取上一个stage数据的时候,说文件找不到,其实不是文件找不到而是程序不响应,因为正在GC.
2.2 Sorted-Based Shuffle介绍
为了缓解Shuffle过程产生文件数过多和Writer缓存开销过大的问题,spark引入了类似于hadoop Map-Reduce的shuffle机制。该机制每一个ShuffleMapTask不会为后续的任务创建单独的文件,而是会将所有的Task结果写入同一个文件,并且对应生成一个索引文件。以前的数据是放在内存缓存中,等到数据完了再刷到磁盘,现在为了减少内存的使用,在内存不够用的时候,可以将输出溢写到磁盘,结束的时候,再将这些不同的文件联合内存的数据一起进行归并,从而减少内存的使用量。一方面文件数量显著减少,另一方面减少Writer缓存所占用的内存大小,而且同时避免GC的风险和频率。

Sort-Based Shuffle有几种不同的策略:BypassMergeSortShuffleWriter、SortShuffleWriter和UnasfeSortShuffleWriter。
对于BypassMergeSortShuffleWriter,使用这个模式特点:

主要用于处理不需要排序和聚合的Shuffle操作,所以数据是直接写入文件,数据量较大的时候,网络I/O和内存负担较重

主要适合处理Reducer任务数量比较少的情况下

将每一个分区写入一个单独的文件,最后将这些文件合并,减少文件数量;但是这种方式需要并发打开多个文件,对内存消耗比较大。

因为BypassMergeSortShuffleWriter这种方式比SortShuffleWriter更快,所以如果在Reducer数量不大,又不需要在map端聚合和排序,而且
Reducer的数目 < spark.shuffle.sort.bypassMergeThrshold指定的阀值,就是用的是这种方式。
对于SortShuffleWriter,使用这个模式特点:

比较适合数据量很大的场景或者集群规模很大。

引入了外部外部排序器,可以支持在Map端进行本地聚合或者不聚合

如果外部排序器enable了spill功能,如果内存不够,可以先将输出溢写到本地磁盘,最后将内存结果和本地磁盘的溢写文件进行合并。

对于UnsafeShuffleWriter由于需要谨慎使用,我们暂不做分析。
另外这个Sort-Based Shuffle跟Executor核数没有关系,即跟并发度没有关系,它是每一个ShuffleMapTask都会产生一个data文件和index文件,所谓合并也只是将该ShuffleMapTask的各个partition对应的分区文件合并到data文件而已。所以这个就需要个Hash-BasedShuffle的consolidation机制区别开来。
首先每一个Mapper会根据Reducer的数量创建出相应的bucket,bucket的数量是M×RM×R,其中MM是Map的个数,RR是Reduce的个数。
· 其次Mapper产生的结果会根据设置的partition算法填充到每个bucket中去。这里的partition算法是可以自定义的,当然默认的算法是根据key哈希到不同的bucket中去。
· 当Reducer启动时,它会根据自己task的id和所依赖的Mapper的id从远端或是本地的block manager中取得相应的bucket作为Reducer的输入进行处理。
· 这里的bucket是一个抽象概念,在实现中每个bucket可以对应一个文件,可以对应文件的一部分或是其他等。
· Apache Spark 的 Shuffle 过程与 Apache Hadoop 的 Shuffle 过程有着诸多类似,一些概念可直接套用,例如,Shuffle 过程中,提供数据的一端,被称作 Map 端, Map 端每个生成数据的任务称为 Mapper,对应的,接收数据的一端,被称作 Reduce 端,Reduce 端每个拉取数据的任务称为 Reducer。
· Shuffle 过程本质上都是将 Map 端获得的数据使用分区器进行划分,并将数据发送给对应的 Reducer 的过程。
shuffle 和 stage
shuffle 是划分 DAG 中 stage 的标识,同时影响 Spark 执行速度的关键步骤.
RDD 的 Transformation 函数中,又分为窄依赖(narrow dependency)和宽依赖(wide dependency)的操作.窄依赖跟宽依赖的区别是是否发生 shuffle(洗牌) 操作.宽依赖会发生 shuffle 操作. 窄依赖是子 RDD的各个分片(partition)不依赖于其他分片,能够独立计算得到结果,宽依赖指子 RDD 的各个分片会依赖于父RDD 的多个分片,所以会造成父 RDD 的各个分片在集群中重新分片, 看如下两个示例:

第一个 Map 操作将 RDD 里的各个元素进行映射, RDD 的各个数据元素之间不存在依赖,可以在集群的各个内存中独立计算,也就是并行化,第二个 groupby 之后的 Map 操作,为了计算相同 key 下的元素个数,需要把相同 key 的元素聚集到同一个 partition 下,所以造成了数据在内存中的重新分布,即 shuffle 操作.shuffle 操作是 spark 中最耗时的操作,应尽量避免不必要的 shuffle.
shuffle过程可能需要完成以下过程
重新进行数据分区
数据传输
数据压缩
磁盘I/O
shuffle工作流程
在运行job时,spark是一个stage一个stage执行的。先把任务分成stage,在任务提交阶段会把任务形成taskset,在执行任务。
spark的DAGScheduler根据RDD的ShuffleDependency来构建Stages:

例如:ShuffleRDD/CoGroupedRDD有一个ShuffleDependency。

很多操作通过钩子函数来创建ShuffleRDD

每个ShuffleDependency会map到spark的job的一个stage,然后会导致一个shuffle过程。

基于sort的shuffle
sort-based的shuffle,会把输入的记录根据目标分区id(partition ids)进行排序。然后写入单个的map输出文件中。为了读取map的输出部分,Reducers获取此文件的连续区域 。当map输出的数据太大而内存无法存放时,输出的排序子集可以保存到磁盘,这些磁盘文件被合并后,生成最终的输出文件。
sort shuffle有两个不同的输出路径来产生map的输出文件:

序列化排序(Serialized sorting)
在使用序列化排序时,需要满足以下3个条件:

shuffle不指定聚合(aggregation)或输出排序方法。

shuffle的序列化程序支持序列化值的重定位(KryoSerializer和Spark SQL的自定义序列化程序目前支持此操作)。

shuffle产生小于16777216个输出分区。

反序列化排序(Deserialized sorting)
用来处理所有其他情况。

Sort Shuffle Writer
· 每个map任务都会产生一个shuffle数据文件,和一个Index文件

· 通过外部排序类ExternalSorter对数据进行排序

· 若map-side需要进行合并(combine)操作,数据将会按key和分区进行排序,若没有合并操作数据只会根据分区进行排序。

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转载自blog.csdn.net/u014033218/article/details/86561446
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