MaxEnt(最大熵)模型使用方法-系统教程

MaxEnt模型是通过物种已知分布数据和相关环境变量来推算物种的生态需求,然后将运算结果投射至不同的空间和时间中以预测物种的潜在分布区。由于对样本需求量要求小、预测能力优等特点,已被广泛应用于物种潜在分布区预测、外来入侵物种风险评估及气候变化对生物多样性的影响等研究中。在知网上参看可以发现近年来相关文献非常多,涉及到农、林、生物等各方面领域。

     本文将以MaxEnt3.4为例,介绍模型的使用过程。(安装包文末自取)

数据:物种分布点,环境变量

软件:MaxEnt(软件需要在java环境下运行 ,记得一同安装),ArcGIS

步骤:

  1. 数据预处理

      将物种分布点按照物种名、经度、纬度的顺序保存为.CSV格式的文件。环境变量19个,采用的世界气候数据库中的数据(http://www.worldclim.org),用ArcGIS中掩膜提取(extract by mask)裁剪出中国范围的数据,变量较多可以采取批处理功能(batch)或Arcpy一次性处理完。

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         在MaxEnt模型中环境变量数据格式需要ASCII,因此需要在ArcGIS中采用Raster to ASCII进行数据格式转化。

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2. MaxEnt 模型运行

      按照软件提示输入数据,设置结果内容中可以根据需求勾选“创建响应曲线,预测图,采用刀切法评估变量重要性”的选项。点击页面下方setting可以根据自己需要对参数进一步优化。

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2. 运行结果及出图

      ①运行结果里plots里面为所有的结果图,如响应曲线,变量贡献度、ROC曲线(主要表达模型预测精度)以及预测结果分布图。***.csv为响应曲线和贡献度数据,如果嫌弃图不好看或者清晰度不够,可以采用里面的数据自己重新出图。

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     ②ASC文件为最终的的物种预测分布,将其在ArcGIS中打开进行分层设色,加入国界线、省界线以及海岸线并进行图幅整饰,输出物种分布适宜区预测图。

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邵周玲,周文佐,杨帆等.基于MaxEnt模型的绞股蓝潜在适生区预测[J].南方农业学报.2021(04):1124-1131.

附件:

https://pan.baidu.com/s/1YgQgnXv1egziBOEC2YOwBg

提取码:9hyl

(MaxEnt3.4.4+Java)

本文来源:邵王子GIS

更多内容:基于MaxENT模型的不同尺度区域物种适宜区预测及多物种适宜区分析

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转载自blog.csdn.net/hu397313168/article/details/134142246
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