MATLAB之TOPAS输出文件拟合高斯分布并提取参数

此处需要将TOPAS跑出来的数据进行高斯拟合，并计算标准差sigma，以准备下一步的分析使用。csv数据类型如上篇文章所述，因为对TOPAS程序直接设定了输出文件的格式是“能量MeV+束斑大小cm+RangeShift宽度x空气间隙宽度”，此处用循环读取程序并输出到一个保存结果的xlsx文件中。本来可以直接用list=dir()函数以及list(i).name来跑程序，可是给我的文件命名格式有点问题，所以得重写循环。MATLAB用dir读取文件名的时候给出的排序都是从第一位开始依次比较大小，所以一开始定好文件名格式对后面的程序帮助很大。

clc;
clear;
fileDir='C:\Users\32628\Documents\MATLAB\results\';
%创建用于存放Sigma的数组
valueM=zeros(10,18);
row=1;
column=1;
for k=70:10:100
    for j=1:1:3+(k-70)/10
        for i=5:5:50
            %读取文件名
            kk=num2str(k);
            jj=num2str(j);
            ii=num2str(i);
            filename=strcat(kk,'MeV',jj,'cm',ii,'.csv');
            filename2=strcat(fileDir,filename);
            file=csvread(filename2,8,0);
            yvalue=file(:,4);
            xvalue=file(:,1);
            %设置要用的拟合模型
            [xData, yData] = prepareCurveData( xvalue, yvalue );
            ft = fittype( 'gauss1' );
            opts = fitoptions( 'Method', 'NonlinearLeastSquares' );
            %opts.Display = 'Off';
            %opts.Lower = [-Inf -Inf 0];
            %opts.StartPoint = [39194592 299 24.6030834338969];
            %将模型用于数据
            [fitresult, gof] = fit( xData, yData, ft, opts );
            % Plot fit with data.
            %figure( 'Name', 'Normal Fit' );
            %h = plot( fitresult, xData, yData );
            %legend( h, 'yvalue vs. xvalue', 'untitled fit 1', 'Location', 'NorthEast' );
            % Label axes
            %xlabel xvalue
            %ylabel yvalue
            %grid on
            valueM(row,column)=(fitresult.c1)/2^(1/2);
            if i~=50
                row=row+1;
            else
                row=1;
                column=column+1;
            end
        end
    end
end
xlswrite('C:\Users\32628\Documents\MATLAB\sigma.xlsx',valueM,'Sheet1','B2');

本来想直接用normfit()来得到sigma的，但发现用这个函数得到的sigma有问题，才另想办法用cftool来拟合数据并用Generate Code来跑。