深度学习用于医学预后-第二课第四周21-23节-使用Harrell C-Index评估生存模型(实例)

我们学会了 Harrell C-index 的计算公式,接下来我们通过实际例子来进一步学习吧

让我们看一个例子,其中有一组患者,并尝试计算这个特定风险模型的 Harrell C-index。

现在,我们有一个风险模型,他输出了每个患者的风险得分,让我们看看如何评估这个数据上的模型好坏。

可能得允许配对

好的,我们的第一步是查看该数据集中的可允许对,所以让我们首先尝试找出哪些对是允许的。

现在让我们看A、B两个,A在事件时间之前发生了删失,我们无法比较结果,因此这不是一个允许对。

我们现在看A、C,A在C之后删失,因此这将是一个允许对。

然后我们可以查看A、D,这两个时间都被删失了,因此我们无法进行比较。A、E也是一个合规的允许对。

现在让我们看B和C。这两个都有事件,因此我们肯定可以进行比较

B和D可以看到删失是在事件之前发生的,因此这不会是一个可允许对。

B和E这两个都是事件,因此这肯定是一个允许对。

现在让我们看C和D是第一个。请注意这里,C和D是一种情况,在这种情况下,我们有一个事件,但我们知道其中一个在当时被截尾了。现在,当我们知道其中一个在当时被截尾时,我们知道在那个时候或之前他们没有经历过事件,因此我们知道最坏的结果是C,因此这是一个可允许对。

请注意:到目前为止我只看 T 列。我根本没看 Risk 列,因为我们在确定一对是否可允许时不需要风险列。

让我们看C和E,并注意这也是一对合规的允许对,因为两者都是事件。最后,让我们看D和E,并意识到对于D,删失是在事件时间之前发生的,因此我们无法比较这两个,因此有六个可允许的对。

一致性配对

现在让我们看看我们的一致配对。请注意,当我们查看一致配对时,我们只需要查看允许的配对,因为只有允许的配对才是可比较的。

请记住,一致性指的是:最坏结果的病人是否具有更高的风险得分?

对于 A、C,我们的风险是0.65和0.7,最坏的结果是患者C且得分最高,因此A、C是一致的。A、E 这一对,我们可以看到,最坏的结果是 E,且 E 有更高的风险得分,因此 A、E 也是一致的一对。

现在让我们看B、C。对于 B、C,我们都有事件和更高的风险分配给 B,但 B 的生存时间更长,因此这不是一致的一对。最后,让我们看B、E。在 B、E 中,我们将高风险分配给 B,但这是生存时间更长,因此这也不是一致的一对。

让我们看一下 C、D。对于 C、D,我们发现最坏的结果是 C,而 C 的风险更高,因此这是一致的一对。最后,我们有 C,E,其中最坏的结果是 C,但更高的风险是 E,因此这不是一致的一对。

让我们看看是否有任何平局(risk tie)。我们没有任何平局因为我们已经经历了所有的配对。因此,在这里我们只需写 None。带入公式计算:我们的C-Index 为3/6,相当于0.5。

大大大大总结

恭喜你完成了这门课程的最后一周。本周,你学习了如何基于患者档案构建和评估个性化的生存预测模型。你学习了Cox比例风险模型和生存树等生存模型,可以利用患者变量来获取患者特定的风险。你还学习了如何使用Harrell’s C-index来评估生存数据上的生存模型。在你的最后一项任务中,你将有机会将所有这些概念应用到实际数据中,建立一个预测住院患者死亡率的生存模型。

我也是第一次接触预后模型,很多概念对我来讲都是新的。这部分只是我的一个学习笔记,当遗忘的时候可以翻出来看看,快速回忆。当然,也希望对你有用。

下一步分内容就是大作业,实战环节啦~~~

敬请期待!!!

文章持续更新,可以关注微信公众号【医学图像人工智能实战营】获取最新动态,一个关注于医学图像处理领域前沿科技的公众号。坚持已实践为主,手把手带你做项目,打比赛,写论文。凡原创文章皆提供理论讲解,实验代码,实验数据。只有实践才能成长的更快,关注我们,一起学习进步~

我是Tina, 我们下篇博客见~

白天工作晚上写文,呕心沥血

觉得写的不错的话最后,求点赞,评论,收藏。或者一键三连
在这里插入图片描述

猜你喜欢

转载自blog.csdn.net/u014264373/article/details/130837663