甲基化是DNA的一种重要化学修饰，可调节基因的表达和关闭，与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。测序技术的发展，极大促进了单细胞DNA甲基化研究。然而大量数据的不断积累，对单细胞DNA甲基化数据的管理和利用提出了巨大的挑战。scMethBank作为第一个开放访问的综合数据库，全面整合了不同研究发表的数据，可用于单细胞 DNA 甲基化数据和元数据的收集、整合、分析和可视化。
该数据库可访问地址：
https://ngdc.cncb.ac.cn/methbank/scm/
scMethBank包括了来自人类和小鼠的8328个样本的全基因组单细胞DNA甲基化图谱和原始数据，涵盖15个项目，29种细胞类型和两种疾病。胚胎细胞(11.0%)、癌细胞(14.4%)、生殖细胞(10.7%)、神经细胞(54.5%)、干细胞(7.9%)、其他类型的细胞(2.3%)均被记录在数据库中。生物学背景包括早期胚胎发育、癌症进展、细胞分化和衰老。
scMethBank中所有的数据都可以自由访问，支持数据集、组织、细胞类型、治疗方法、疾病等多项检索功能，用户还可以通过浏览、可视化、工具和下载四个功能模块浏览整个数据库。此外，在文档页面中可以访问数据库的使用说明。scMethBank旨在通过提供浏览、搜索、可视化、下载功能和用户友好的在线工具，帮助对细胞异质性感兴趣的研究人员在单细胞水平上探索和利用全基因组甲基化数据。
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凌恩-盈飞团队
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参考文献
scMethBank: a database for single-cell whole genomeDNA methylation maps.Nucleic Acids Research,2021