Python实现鸢尾花数据集分类问题——基于skearn的SVM
代码如下：
1 # !/usr/bin/env python
2 # encoding: utf-8
3 __author__ = 'Xiaolin Shen'
4 from sklearn import svm
5 import numpy as np
6 from sklearn import model_selection
7 import matplotlib.pyplot as plt
8 import matplotlib as mpl
9 from matplotlib import colors
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13 # 当使用numpy中的loadtxt函数导入该数据集时，假设数据类型dtype为浮点型，但是很明显数据集的第五列的数据类型是字符串并不是浮点型。
14 # 因此需要额外做一个工作，即通过loadtxt()函数中的converters参数将第五列通过转换函数映射成浮点类型的数据。
15 # 首先，我们要写出一个转换函数：
16 # 定义一个函数，将不同类别标签与数字相对应
17 def iris_type(s):
18 class_label={b'Iris-setosa':0,b'Iris-versicolor':1,b'Iris-virginica':2}
19 return class_label[s]
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21 #（1）使用numpy中的loadtxt读入数据文件
22 filepath='IRIS_dataset.txt' # 数据文件路径
23 data=np.loadtxt(filepath,dtype=float,delimiter=',',converters={4:iris_type})
24 #以上4个参数中分别表示：
25 #filepath ：文件路径。eg：C:/Dataset/iris.txt。
26 #dtype=float ：数据类型。eg：float、str等。
27 #delimiter=',' ：数据以什么分割符号分割。eg：‘，’。
28 #converters={4:iris_type} ：对某一列数据（第四列）进行某种类型的转换，将数据列与转换函数进行映射的字典。eg：{1:fun}，含义是将第2列对应转换函数进行转换。
29 # converters={4: iris_type}中“4”指的是第5列。
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31 # print(data)
32 #读入结果示例为：
33 # [[ 5.1 3.5 1.4 0.2 0. ]
34 # [ 4.9 3. 1.4 0.2 0. ]
35 # [ 4.7 3.2 1.3 0.2 0. ]
36 # [ 4.6 3.1 1.5 0.2 0. ]
37 # [ 5. 3.6 1.4 0.2 0. ]]
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41 #（2）将原始数据集划分成训练集和测试集
42 X ,y=np.split(data,(4,),axis=1) #np.split 按照列（axis=1）进行分割，从第四列开始往后的作为y 数据，之前的作为X 数据。函数 split(数据，分割位置，轴=1（水平分割） or 0（垂直分割）)。
43 x=X[:,0:2] #在 X中取前两列作为特征（为了后期的可视化画图更加直观，故只取前两列特征值向量进行训练）
44 x_train,x_test,y_train,y_test=model_selection.train_test_split(x,y,random_state=1,test_size=0.3)
45 # 用train_test_split将数据随机分为训练集和测试集，测试集占总数据的30%（test_size=0.3),random_state是随机数种子
46 # 参数解释：
47 # x：train_data：所要划分的样本特征集。
48 # y：train_target：所要划分的样本结果。
49 # test_size：样本占比，如果是整数的话就是样本的数量。
50 # random_state：是随机数的种子。
51 # （随机数种子：其实就是该组随机数的编号，在需要重复试验的时候，保证得到一组一样的随机数。比如你每次都填1，其他参数一样的情况下你得到的随机数组是一样的。但填0或不填，每次都会不一样。
52 # 随机数的产生取决于种子，随机数和种子之间的关系遵从以下两个规则：种子不同，产生不同的随机数；种子相同，即使实例不同也产生相同的随机数。）
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55 #（3）搭建模型，训练SVM分类器
56 # classifier=svm.SVC(kernel='linear',gamma=0.1,decision_function_shape='ovo',C=0.1)
57 # kernel='linear'时，为线性核函数，C越大分类效果越好，但有可能会过拟合（defaul C=1）。
58 classifier=svm.SVC(kernel='rbf',gamma=0.1,decision_function_shape='ovo',C=0.8)
59 # kernel='rbf'（default）时，为高斯核函数，gamma值越小，分类界面越连续；gamma值越大，分类界面越“散”，分类效果越好，但有可能会过拟合。
60 # decision_function_shape='ovo'时，为one v one分类问题，即将类别两两之间进行划分，用二分类的方法模拟多分类的结果。
61 # decision_function_shape='ovr'时，为one v rest分类问题，即一个类别与其他类别进行划分。
62 #开始训练
63 classifier.fit(x_train,y_train.ravel())
64 #调用ravel()函数将矩阵转变成一维数组
65 # （ravel()函数与flatten()的区别）
66 # 两者所要实现的功能是一致的（将多维数组降为一维），
67 # 两者的区别在于返回拷贝（copy）还是返回视图（view），
68 # numpy.flatten() 返回一份拷贝，对拷贝所做的修改不会影响（reflects）原始矩阵，
69 # 而numpy.ravel()返回的是视图（view），会影响（reflects）原始矩阵。
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72 def show_accuracy(y_hat,y_train,str):
73 pass
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75 #（4）计算svm分类器的准确率
76 print("SVM-输出训练集的准确率为：",classifier.score(x_train,y_train))
77 y_hat=classifier.predict(x_train)
78 show_accuracy(y_hat,y_train,'训练集')
79 print("SVM-输出测试集的准确率为：",classifier.score(x_test,y_test))
80 y_hat=classifier.predict(x_test)
81 show_accuracy(y_hat,y_test,'测试集')
82 # SVM-输出训练集的准确率为： 0.838095238095
83 # SVM-输出测试集的准确率为： 0.777777777778
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86 # 查看决策函数，可以通过decision_function()实现。decision_function中每一列的值代表距离各类别的距离。
87 # print('decision_function:\n', classifier.decision_function(x_train))
88 print('\npredict:\n', classifier.predict(x_train))
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91 # (5)绘制图像
92 # 1.确定坐标轴范围，x，y轴分别表示两个特征
93 x1_min, x1_max = x[:, 0].min(), x[:, 0].max() # 第0列的范围 x[:, 0] "："表示所有行，0表示第1列
94 x2_min, x2_max = x[:, 1].min(), x[:, 1].max() # 第1列的范围 x[:, 0] "："表示所有行，1表示第2列
95 x1, x2 = np.mgrid[x1_min:x1_max:200j, x2_min:x2_max:200j] # 生成网格采样点（用meshgrid函数生成两个网格矩阵X1和X2）
96 grid_test = np.stack((x1.flat, x2.flat), axis=1) # 测试点，再通过stack()函数，axis=1，生成测试点
97 # .flat 将矩阵转变成一维数组 （与ravel()的区别：flatten：返回的是拷贝
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99 print("grid_test = \n", grid_test)
100 # print("x = \n",x)
101 grid_hat = classifier.predict(grid_test) # 预测分类值
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103 print("grid_hat = \n", grid_hat)
104 # print(x1.shape())
105 grid_hat = grid_hat.reshape(x1.shape) # 使之与输入的形状相同
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108 # 2.指定默认字体
109 mpl.rcParams['font.sans-serif'] = [u'SimHei']
110 mpl.rcParams['axes.unicode_minus'] = False
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112 # 3.绘制
113 cm_light = mpl.colors.ListedColormap(['#A0FFA0', '#FFA0A0', '#A0A0FF'])
114 cm_dark = mpl.colors.ListedColormap(['g', 'r', 'b'])
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116 alpha=0.5
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118 plt.pcolormesh(x1, x2, grid_hat, cmap=cm_light) # 预测值的显示
119 # plt.scatter(x[:, 0], x[:, 1], c=y, edgecolors='k', s=50, cmap=cm_dark) # 样本
120 plt.plot(x[:, 0], x[:, 1], 'o', alpha=alpha, color='blue', markeredgecolor='k')
121 plt.scatter(x_test[:, 0], x_test[:, 1], s=120, facecolors='none', zorder=10) # 圈中测试集样本
122 plt.xlabel(u'花萼长度', fontsize=13)
123 plt.ylabel(u'花萼宽度', fontsize=13)
124 plt.xlim(x1_min, x1_max)
125 plt.ylim(x2_min, x2_max)
126 plt.title(u'鸢尾花SVM二特征分类', fontsize=15)
127 # plt.grid()
128 plt.show()
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134 #输出训练集的准确率
135 print(classifier.score(x_train,x_test))
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137 #由于准确率表现不直观，可以通过其他方式观察结果。
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139 #首先将原始结果与训练集预测结果进行对比：
140 y_train_hat=classifier.predict(x_train)
141 y_train_1d=y_train.reshape((-1))
142 comp=zip(y_train_1d,y_train_hat) #用zip把原始结果和预测结果放在一起。显示如下：
143 print(list(comp))
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145 #同样的,可以用训练好的模型对测试集的数据进行预测:
146 print(classifier.score(x_test,y_test))
147 y_test_hat=classifier.predict(x_test)
148 y_test_1d=y_test.reshape((-1))
149 comp=zip(y_test_1d,y_test_hat)
150 print(list(comp))
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153 #还可以通过图像进行可视化：
154 plt.figure()
155 plt.subplot(121)
156 plt.scatter(x_train[:,0],x_train[:,1],c=y_train.reshape((-1)),edgecolors='k',s=50)
157 plt.subplot(122)
158 plt.scatter(x_train[:,0],x_train[:,1],c=y_train_hat.reshape((-1)),edgecolors='k',s=50)
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程序运行结果：
数据可视化展示：
