前言
ImageJ是一款基于 java的，由 National Institutes of Health（NIH）开发的一款功能强大的图像处理软件，在科研中应用极为广泛。ＩｍａｇｅＪ可对图像进行各种操作，可Windows，MacOS，Linux等不同操作系统平台上工作。
ＩｍａｇｅＪ有着很强大的图像处理能力，它能够显示、编辑、分析、处理、保存、打印８位、16位和32的图片，支持TIFF、JPEG、BMP、DICOM和FITS等多种格式。另外ＩｍａｇｅＪ还支持图像巧及超找和虚拟找）操作，就是通过一个窗口中多线程的层叠多个图像，并行间时对多幅图像或者图像序列进行操作。在内存足够的情况下，ＩｍａｇｅＪ能读取任意数量的图像，并实行操作。
1 下载安装
下载地址：https://imagej.net/Fiji/Downloads
根据电脑的环境选择对应的安装包下载。
ImageJ需要Java环境,可以在https://www.oracle.com/java/technologies/javase-downloads.html下载jdk。
ImageJ解压后就能使用。
第一次安装需要更新插件。
2 使用
magej菜单栏列出了ImageJ的所有命令：
File：基本的文件操作，包括打开、保存、创建新图片，大多数命令看名字就知道什么意思
Edit：编辑和绘制操作，以及全局设定
Image：图像显示，包括图像格式的转化、怎样显示等
Process：图像处理，包括点操作、过滤器和算术运算
Analyze：图像分析，统计测量、直方图绘制和其他与图像分析有关的操作
Plugins：创建、编辑和管理插件，列出了用户安装的所有宏、脚本和插件。
Window：已打开的窗口的选择和管理
Help：升级，文档资源和版本信息
2.1图片导入
导入图片：File>open>选择图片>打开
2.2 预处理
中值滤波：
Procsaa>Noise>Despeckle
2.3 二值化
二值化：
Procsaa>Binary>Make Binary
开操作，即先腐蚀后膨胀。这将平滑对象及去除独立的像素点
Procsaa>Binary>Open
闭操作，即先膨胀后腐蚀。这将平滑对象及填充小洞
Procsaa>Binary>Close
3.其它
遇到困难可以查看官方文档：https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/index.html
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