nii格式和mat格式转化(只针对功能磁共振成像)

mat格式与nii格式的ROI转化

问题描述:

我是在对壳核分割的时候出现的这个问题,因为我要用分割出来的壳核或者是从wfupickatlas中定义的ROI来和自己设置的ROI来进行combine取交集。这时就出现了一个问题,前面定义的出来的格式是nii格式的,而用MarsBar定义的ROI是mat格式的,并且MarsBar只能识别mat格式的roi。于是上网查两者的格式如何转化,也有好多方法来实现互相转化,这里就不说了,因为并没有解决我的这个问题,我将nii转换为mat后MarsBar并不能识别。困惑了好久,才发现MarsBar本身就可以实现。。。。(有点尴尬)

具体方法:

方法其实很简单,MarsBar界面有个ROI definition,这个选项下面就有Import/Export两个按钮(之前一直没管过是干什么的,以后还是得多注意),直接演示吧。

nii转mat

因为MarsBar是mat格式的,因此选择Import导入按钮来进行转化:

点击Import,如下:
在这里插入图片描述
选择cluster image,点击:
在这里插入图片描述
然后,选择nii格式的图片,done
在这里插入图片描述
选择输出路径,然后Done,如下:
在这里插入图片描述
其他的默认就行
在这里插入图片描述
之后就转化成功了,如下,这里之所以是两个mat是因为Putamen是经过左右合并后的:
在这里插入图片描述
之后就可以选择view来查看了:
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

mat转nii

这里使用Export选项,操作如下:
在这里插入图片描述
点击cluster image,如下:
在这里插入图片描述
选择mat文件,done,如下:
在这里插入图片描述
选择输出文件:
在这里插入图片描述
文件名设置如下,回车即可。
在这里插入图片描述
nii结果如下:
在这里插入图片描述

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