利用matlab的SPM12进行功能核磁共振成像数据处理_Auditory fMRI data(一)

大脑成像的每次采样包括64个连续的切片。大脑的三维图像大小为64X64X64,每个像素的大小为3X3X3立方毫米。TR时间设置为7s。(TR是指第一個RF到下一個相同RF出現時,中間間隔的時間。RF,射频脉冲)。a single project 进行了96次mri数据收集,总共6个block,每个block进行16次acquisitions。一开始的设定为休息,然后给予受试者听觉刺激,然后再休息,再刺激。听觉刺激利用双音节词以每分钟60次的频率进行刺激。
SPM官网提供了受试者fmri的原始文件,网址为

https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/data/auditory/

结构像数据保存在sM00223文件夹下。数据的文件格式为Analyze format,为了分析数据,首先建好三个文件夹,如图所示,建立好文件夹
1.dummy scans
为了避免T1对fmri时间序列的影响,需要放弃前面几次扫描的数据。discard the first complete cycle (12 scans, 04-15),leaving 84 scans, image files 16-99。并且把这些数据放在dummy文件夹里。
2.1Realignment对数据进行重新排列

启动SPM后点击fmri
然后matlab输入SPM,点击fmri。按照以下步骤进行,
在这里插入图片描述
运行完程序后,matlab窗口出现‘Done ‘Realign: Estimate & Reslice’’。然后得到两个结果,记录受试者的头动情况。
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2.2 Coregistration配准
在fmr初始界面选择Coregister,然后按照如下指令操作。
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SPM将在结构像数据和功能像数据建立起关联,
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