迷惘的黑夜中找寻一盏灯
Alpha多样性之箱线图的解读
以下内容转载： 扩增子图表解读1箱线图：Alpha多样性，老板再也不操心的我文献阅读了
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图中元素解释
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Y轴标签Estimaated species Richness代表估计的物种丰富度信息，刻度范围从0-2000可能代物OTU数量，高低对应物种丰富度即数量的高低；根据我的理解Y轴的刻度应为Observed OTU(即直接统计测序样品中按97%聚类16S的种类，虽然作者説是Shannon)；
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X轴将标签放在了上方(更常见位于下方)，分别代表三个地区，作者采用按地区先分组，因为不同地区环境差异较大，一般先把主要差异因素分开；其次，这篇文章更关注的是水稻不同部分的微生物组，不是部分要在同一地点下进行比较才是单因素变化的分析；
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右侧图例表示不同取样位置：从上到下分为土(Bulk Soil)、根际(Rhizosphere)、根表(Rhizoplane)和根内(Endosphere)四类，对应图中每个地区中箱体的不同颜色；
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图中颜色箱体代表该组数据中间50%的分布区间，中间线为中位数，上下延长线端点分两种情况：如果范围小于1.5倍箱体则为最大或最小值；否则最远为1.5倍箱体长度的线。详细讲解可观看斯坦福 医学统计课程第一单元
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图表意义：从不同地区看，可以看到多样性差别，代表土壤和环境条件可以影响微生物组；从取样的不同部分看，发现多样性差别极大，且不同地区有相同趋势；
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图观察规律或结论：从根际-根表-根内，细菌的多样性逐渐下降的。不同地区的差别小于不同部分的差别。
讲解详细，易懂。
总结
学习解读图表的套路：
1，纵横坐标代表的意思；
2，图例说明；
3，图表趋势以及规律；
4，得出结论