sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘

警钟长鸣!癌症离我们远吗?

前言:《我不是药神》催人泪下,笔者在此警钟长鸣,癌症不是小概率疾病,癌症就在身边。癌症早期发现和控制可极大延长寿命和减少治疗费用。笔者下载美国威斯康辛临床数据,运用python sklearn建立乳腺癌分类器模型,可预测正常细胞和癌细胞。

 

最近,徐峥的《我不是药神》上映8天,累计票房已过13亿,其口碑过硬,跻身年度国产片票房榜第四名。电影主角原型是无锡人陆勇,一位企业家,许多白血病患者称他为“药神”。 进口抗白血病药物格列宁太贵,普通患者无法承受而默默等死。陆勇从印度带来廉价格列宁仿制药挽救上千名病友。2013年竟因涉嫌贩卖“假药”,被警方带走。之后千余名白血病病友签名为陆勇求情,最终有关部门“撤回起诉”。 这部电影催人泪下,笔者看完这部电影后,感触极深,我想提醒各位睡梦中的朋友,癌症真的离我们遥远吗?

杜甫曾作诗:

好雨知时节,当春乃发生。

随风潜入夜,润物细无声

其诗描述了春雨慢慢到来过程。其实随着现代化进程,癌症就像一场慢性瘟疫,渐渐融入我们每个家庭,并在全球扩散。记者采访中一个美国妇女说隔壁邻居患了癌症,家人也患了癌症,朋友也患了癌症。以前癌症是个很遥远的概率,现在到处都听说他的存在。癌症就像一个死亡幽灵,飘荡在城市的各个角落。

Laura ROZEK,美国密歇根州大学公共卫生学院教授,生物统计学家,环境学家。她在一次TED演讲中讲到有毒物质进入体内后可以引起DNA断裂,引发DNA突变。正常细胞失去原有功能后可能转变为癌细胞。泰国数据统计:工业污染区域癌症概率非常高,远远高于正常的1/5。

 

几十年前癌症还是小概率疾病,患病率较低。随着化工产品对自然生态污染,电磁辐射,,食品添加剂污染,较快生活节奏,加班熬夜对身体透支,癌症患病率逐年增高,目前癌症肿瘤是人类最大杀手之一,每年侵蚀上万生命。天价药品专利费可以让一盒7颗抗癌药物卖到几千到几十万。巨大商业利益驱使国内外大型国药企对抗癌新药研发投入,研发费用逐年上升,纷纷抢夺和瓜分癌症治疗市场。

经过长时间的数据清洗和统计,我得到了2000-2016年美国在研新药申请数量表。根据治疗疾病分类,排名第一的是抗肿瘤类药物,排名第二的是抗癌症类药物(肿瘤有良性和恶性,癌指恶性肿瘤,)。众所周知,癌症肿瘤类新药研发难度大,耗时长,成功率低,费用高。从临床前期到临床四期,可能要砸十几亿。即便如此高的成本风险,何罗氏,武田,雅培等大佬还是往这个领域砸钱?答案是肯定的,巨大市场和经济利益远远高于成本。

 

我在这里警钟长鸣,各位观众,癌症不是遥不可及,不是和你没关系,癌症就在你或家人朋友身边。良好教育和早期预防知识可以挽救你的生命,挽救你家人的生命,挽救你朋友的生命。

很多悲剧是可避免的,早期对癌细胞的发现和治疗可以极大控制癌细胞扩散,有助于延长生命。癌症中期和晚期的治疗成本远远高于早期,因此早发现早治疗,早控制,积极调整生活方式,建立健康和平衡的生活节奏。在印度很多进口药被强行取消专利,在国内十几万的药品在印度几百元即可买到。再次强调早期发现和治疗癌症可以延长生命时间并节约治疗费用。

我用Python对美国威斯康辛临床数据进行挖掘,发现癌细胞比正常细胞要大,半径更长,周长更长,凹凸不平,形态各异,非常有趣。

此课程有较大临床价值和商业,曾经吸引多名科研机构和三甲医院教授关注,并商讨临床合作和商业合作。运用机器学习算法探索人体奥义,挖掘癌细胞的特征,利于早期发现癌细胞。

课程名:sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘

学习平台:网易云课堂

网址:https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005269003

课程特点:

讲解了癌症常识,癌症是如何引起的。我们如何避免癌症。

以实际案例为导向,贯穿机器学习算法原理,运用了python sklearn,spss和Excel工具。

运用了决策树,神经网络,因子分析,支持向量机等算法建立分类器,预测细胞是癌细胞或正常细胞。

本视频系列通俗易懂,课程针对学生,老师,医学癌症领域,生物信息学,python爱好者,机器学习领域,算法和模型爱好者。

本视频教程系列有完整python代码,观众看后可以下载实际操作。

数据来自美国威斯康辛临床机构的真实数据!观众也可以根据教程指示去官网下载。

视频教程部分截图:

癌细胞常事,癌细胞和正常细胞区别

 

下图是决策树可视化,运用决策树算法建立分类器,预测正常细胞和癌细胞

 

下图用随机森林挖掘癌细胞因子的权重。

 

下图用神经网络可视化癌细胞因子权重

 

作者Toby,在马上消费金融股份有限公司模型验证专家。曾在国内最大医药数据中心担任过医药数据库负责人,与重庆市中药研究所,中科院重庆绿色智能技术研究院有过项目合作!

猜你喜欢

转载自www.cnblogs.com/webRobot/p/9299252.html