mLife Forum | 微生物组和数据挖掘

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微生物组与生态环境和人体健康息息相关。随着微生物组研究和组学技术的蓬勃发展,产生了海量的微生物组数据。它们的有效挖掘和利用,对于揭示微生物与病原互作、精准治疗以及环境治理等具有重要意义。本期mLife学术论坛将聚焦微生物组和数据挖掘领域的前沿研究成果,展示微生物与宿主互作、微生物组调控、数据挖掘方法等最新研究进展。

直播信息

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主持人简介

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赵方庆 研究员

mLife副主编

中国科学院北京生命科学研究院研究员。先后获得基金委优秀青年基金(2017)、北京市杰出青年科学基金(2018)、国家杰出青年科学基金(2020)、中国科学院特聘研究员(2022)等资助。现任中科院北京生科院科研部副主任,中国生物信息学会基因组信息学专委会主任。主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与人类健康和疾病的关系。近年来,在Cell, Gut, Nature Biotechnology, Nature Computational Science, Nature Communications等刊物上发表通讯作者论文50余篇,其中10余篇入选ESI高被引论文。先后4次荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017, 2018, 2019, 2021)以及“中国科学院大学领雁奖章”(2020)、“中国科学院朱李月华优秀教师奖”(2020)。

嘉宾简介

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孙丰珠 教授

南加州大学(USC)定量与计算生物学教授。他于2012年被选为美国科学促进协会会士, 2015年被选为美国统计学会会士。2012年获得南加州大学“Mellon指导青年教师奖”,2017年获得南加州大学Dornsife文理学院Raubenheimer终身成就奖。他开发了几种广泛使用的宏基因组学算法,包括 LSA, GRAMMy, VirFinder, DeepVirFinder, VirHostMatcher, VirHostMatcher-Net等。他在PNAS, Genome Research, Genome Biology, American Journal of Human Genetics, NAR, Bioinformatics, BIB等杂志上已发表200多篇文章,他引12000多次。

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刘洋彧 副教授

Dr. Yang-Yu Liu is currently an Associate Professor of Medicine at Harvard Medical School (HMS) and an Associate Scientist at Brigham and Women’s Hospital (BWH). He received his PhD in Physics from University of Illinois at Urbana-Champaign in 2009. After that, he held positions as Postdoctoral Research Associate and then Research Assistant Professor in the Center for Complex Network Research at Northeastern University, before he joined HMS and BWH in 2013. His current research efforts focus on the study of human microbiome from the community ecology, dynamical systems, control theory, and machine learning perspectives. For more information, please visit http://scholar.harvard.edu/yyl/.

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朱山风 研究员

复旦大学类脑智能研究院研究员,香港城市大学博士, 京都大学博士后,UIUC访问学者,UniProt 国际科学顾问委员会委员。主要研究人工智能与生物医学大数据挖掘,特别是生物医学文本挖掘、蛋白功能预测、宏基因组、智慧医疗等。论文以第一或通讯作者发表在NeurIPS, ISMB, KDD, IJCAI, Bioinformatics, NAR等。2014——2022年参加BioASQ大规模生物医学文献自动标注国际竞赛中8次取得第一名。2017年参加CAFA大规模蛋白功能自动标注国际竞赛,在全世界50多个实验室中获得第一名。2019——2021年参加CAMI II大规模宏基因组数据解析国际竞赛在重叠群分箱算法中整体排名第一。

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关于mLife

作为中国微生物学领域第一本综合性高起点英文期刊,mLife及时报道国内外微生物学领域高水平科研成果和前沿进展,为微生物学科研工作者搭建一个高水平的学术交流平台。

期刊网站:http://mlife.im.ac.cn/          https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770100x

投稿网站:https://mc.manuscriptcentral.com/mlife

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