全长转录组测序在植物中的应用研究进展 赵陆滟,曹绍玉,龙云树,张应华,许俊强

基因组和转录组测序是生命科学领域的基础
性工作[1]。高通量测序技术正向着高通量、低成本、长读取长度的方向发展。一代[2-3]
、二代[4-7]测序技术,加快了高通量测序时代的到来,也从单个基因位点的研究上升到全基因组层面的研究[8]。然而,人们对高通量测序技术的研究并没有停止,因此又产生了第三代测序技术(TGS,thirdgeneration sequencing)的单分子测序技术(Singlemolecule sequencing),其中 PacBio 公司的单分子实时(SMRT,Single-molecule realtime)测 序 技 术 已
经商业化[9-10]。全长转录组测序(Iso-Seq,isoform sequencing)技术即单分子实时测序技术[11]。该技术具有超长读长,无需模板扩增、运行时间较短、直接检测表观修饰位点、直接测转录本、较高但完全随机的测序错误等特点[9-10,12],除了单独使用 Iso-Seqseq)加三代测序(Iso-Seq)方法。TGS 技术提供了许多仅通过 SGS(二代测序)技术无法获得的信息[13-14]

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