看看这么多子系统的图标：
第一个是普通子系统（非原子子系统），它的外框是细线条。
选择“Treat as atomic unit”后，它就变成了原子子系统。外框也变成了黑粗线。
其他的子系统（包括函数调用子系统，使能子系统，触发子系统，迭代子系统等）都是原子子系统，因此默认外框也都是黑粗线。
选择为原子子系统后，可以配置独立的采样时间：
在生成代码时还可以有更多的配置：
当选择为“Reusable function”或者“Nonreusable function”时，生成的代码可以为子系统的名称，也可以自定义生成的函数名称和文件名称。
参考资料
Subsystem、Atomic Subsystem、Nonvirtual Subsystem、CodeReuse Subsystem
对各模块进行分组以创建模型层次结构
https://ww2.mathworks.cn/help/simulink/slref/codereusesubsystem.html
这里面对子系统的每个参数有详细的说明。