- InnoDB 支持事务，MyISAM 不支持，这一点是非常之重要。事务是一种高级的处理方式，如在一些列增删改中只要哪个出错还可以回滚还原，而 MyISAM 就不可以了；
- MyISAM 适合查询以及插入为主的应用，InnoDB 适合频繁修改以及涉及到安全性较高的应用；
- InnoDB 支持外键，MyISAM 不支持；
- MyISAM 是默认引擎，InnoDB 需要指定；
- InnoDB 不支持 FULLTEXT 类型的索引；
- InnoDB 中不保存表的行数，如 select count() from table 时，InnoDB；需要扫描一遍整个表来计算有多少行，但是 MyISAM 只要简单的读出保存好的行数即可。注意的是，当 count()语句包含 where 条件时 MyISAM 也需要扫描整个表；
- 对于自增长的字段，InnoDB 中必须包含只有该字段的索引，但是在 MyISAM 表中可以和其他字段一起建立联合索引；清空整个表时，InnoDB 是一行一行的删除，效率非常慢。MyISAM 则会重建表；
InnoDB 支持行锁（某些情况下还是锁整表，如 update table set a=1 where user like ‘%lee%’
两种引擎的比较：
- 大尺寸的数据集趋向于选择InnoDB引擎，因为它支持事务处理和故障恢复。
数据库的大小决 定了故障恢复的时间长短，InnoDB可以利用事务日志进行数据恢复，这会比较快。主键查询 在InnoDB引擎下也会相当快，不过需要注意的是如果主键太长也会导致性能问题。 - 大批的 INSERT语句(在每个INSERT语句中写入多行，批量插入)MyISAM下会快一些，但是 UPDATE语句在InnoDB下则会更快一些，尤其是在并发量大的时候