ggplot2是一款强大的图形可视化R包，其作图方式易于理解，且生成的图形精美，定制化程度也很高，应该是R里面最流行的可视化工具。本文关注于ggplot2包的安装、ggplot2基本作图语法等。
一 ggplot2的安装
> .libPaths("~/R/lib") 如果不安装到默认路径，可以在此设置安装路径
> install.packages("ggplot2")
#以上代码也可以直接用install.packages("ggplot2"，lib=""~/R/lib"")代替，这样就只是把包安装到路径中，并不会载入路径，
#不过后续载入包就找不到路径了，需要在library的时候指定路径载入ggplot2包，进行基础绘图，现在就用ggplot2自带的数据集激进型测试，mgp数据集的描述：Fuel economy data from 1999 and 2008 for 38 popular models of car（美国1999年到2008年38种流行汽车的能源使用数据）,数据库详细说明可参考
https://www.rdocumentation.org/packages/ggplot2/versions/3.0.0/topics/mpg
> library(ggplot2, lib.loc=""~/R/lib"") #如若ggplot2包安装在其它路径，就用lib.loc指定此路径，如在默认路径就不需要设置此参数
> mpg #mpg数据集如下
# A tibble: 234 x 11
manufacturer model displ year cyl trans drv cty hwy fl class
<chr> <chr> <dbl> <int> <int> <chr> <chr> <int> <int> <chr> <chr>
1 audi a4 1.80 1999 4 auto(l… f 18 29 p comp…
2 audi a4 1.80 1999 4 manual… f 21 29 p comp…
3 audi a4 2.00 2008 4 manual… f 20 31 p comp…
4 audi a4 2.00 2008 4 auto(a… f 21 30 p comp…
5 audi a4 2.80 1999 6 auto(l… f 16 26 p comp…
6 audi a4 2.80 1999 6 manual… f 18 26 p comp…
7 audi a4 3.10 2008 6 auto(a… f 18 27 p comp…
8 audi a4 qua… 1.80 1999 4 manual… 4 18 26 p comp…
9 audi a4 qua… 1.80 1999 4 auto(l… 4 16 25 p comp…
10 audi a4 qua… 2.00 2008 4 manual… 4 20 28 p comp…
下面来绘制一个简单的图形-散点图，但是出现了报错，说是没有png supoort，用capiabilities()可查看支持的图片类型，此时需要安装Cairo包来支持，安装方法见 https://www.cairographics.org/download/。首先在bash界面种安装Cairo需要的dev库文件，然后进入R安装Cairo即可。
> p <- ggplot(mpg,aes(x=hwy,y=cty)) + geom_point(aes(color=cyl)) + geom_smooth(method="lm")
> ggsave(filename="point.png",plot=p)
> capabilities()
jpeg png tiff tcltk X11 aqua
TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE
http/ftp sockets libxml fifo cledit iconv
TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE
NLS profmem cairo ICU long.double libcurl
TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE 
$ sudo apt-get install libcairo2-dev #For Debian and Debian derivatives including Ubuntu
$ sudo yum install cairo-devel #For Fedora
$ zypper install cairo-devel #For openSUSE> install.packages("Cairo")
> ggplot(mpg,aes(x=hwy,y=cty)) + geom_point(aes(color=cyl),size=2) #这里的ggsave保存步骤就神略了，后面也一样
ggplot(mpg,aes(hwy,cty)) + geom_point(aes(color=cyl))，这是一般绘图语法，也可以写成ggplot(mpg) + geom_point(aes(hwy,cty,color=cyl))，aes表示进行数据映射，aes括号外面的参数表示直接赋值（与数据没有关系了），其中hwy映射到图上是x轴数据，cty映射到y轴上，cyl映射到颜色属性，图上每一个点的三重属性都得到展示了，一般输入的坐标轴属性有1~3个，如只用1个坐标轴属性值就可画直方图，一般画图是两个属性，在3D图种会用到3个坐标轴属性值，而除了映射到坐标轴的属性值之外，其它的属性如颜色、大写、标记、填充、分面等可以自由设置。
上图是典型的散点图，cyl设置了点的颜色属性，由于cyl是数值，所以就当成了连续变量，映射到颜色属性之后也成了连续的颜色，由于cyl就只有几类数据，可以按照离散变量来设置。
aes里面设置的变量都需要有数据映射，如果没有数据映射直接设置成定值，可在aes外设置，如下设置点的大小。
ggplot(mpg,aes(x=hwy,y=cty)) + geom_point(aes(color=factor(cyl)),size=0.5)
除了geom_point()绘画点图之外，还有很多图形可以绘制，并且可以通过调节参数绘制很多子图形，以下列举几种常见图形。
geom_line() 折线图
geom_bar() 图形图
geom_histogram() 直方图
geom_boxplot() 箱线图
geom_density() 密度函数分布图
geom_area() 面积图，覆盖数据以下的所有区域。
由于ggplot2几何图形都是geom_xxx形式，所以可以在R种列出所有的绘图类型
> library(ggplot2)
> ls("package:ggplot2", pattern="^geom_.+")
[1] "geom_abline" "geom_area" "geom_bar" "geom_bin2d"
[5] "geom_blank" "geom_boxplot" "geom_col" "geom_contour"
[9] "geom_count" "geom_crossbar" "geom_curve" "geom_density"
[13] "geom_density_2d" "geom_density2d" "geom_dotplot" "geom_errorbar"
[17] "geom_errorbarh" "geom_freqpoly" "geom_hex" "geom_histogram"
[21] "geom_hline" "geom_jitter" "geom_label" "geom_line"
[25] "geom_linerange" "geom_map" "geom_path" "geom_point"
[29] "geom_pointrange" "geom_polygon" "geom_qq" "geom_quantile"
[33] "geom_raster" "geom_rect" "geom_ribbon" "geom_rug"
[37] "geom_segment" "geom_smooth" "geom_spoke" "geom_step"
[41] "geom_text" "geom_tile" "geom_violin" "geom_vline" ggplot2在绘图的时候内部进行统计分析，每种几何图形都有默认的统计变换类型，统计变换用stat_xxx形式
> library(ggplot2)
> ls("package:ggplot2",pattern="stat_.+")
[1] "stat_bin" "stat_bin_2d" "stat_bin_hex"
[4] "stat_bin2d" "stat_binhex" "stat_boxplot"
[7] "stat_contour" "stat_count" "stat_density"
[10] "stat_density_2d" "stat_density2d" "stat_ecdf"
[13] "stat_ellipse" "stat_function" "stat_identity"
[16] "stat_qq" "stat_quantile" "stat_smooth"
[19] "stat_spoke" "stat_sum" "stat_summary"
[22] "stat_summary_2d" "stat_summary_bin" "stat_summary_hex"
[25] "stat_summary2d" "stat_unique" "stat_ydensity"
[28] "update_stat_defaults"