机器学习(十一):FP增长(FP-growth)

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引言:

    FP增长(FP-growth)算法是一种高效发现频繁项集的方法,只需要对数据库进行两次扫描。它基于Apriori构建,但在完成相同任务时采用了一些不同的技术。该算法虽然能更为高效地发现频繁项集,但不能用于发现关联规则。
    本文用到的部分术语已在简介中介绍(具体看‘基本概念-关联分析’),这里不再重述。

一、FP-growth算法

    FP-growth算法发现频繁项集的基本过程如下:
① 构建FP树
② 从FP树中挖掘频繁项集



二、构建FP树

    FP树是一种输入数据的压缩表示,它通过逐个读入事务,并把事务映射到FP树中的一条路径来构造。由于不同的事务可能会有若干个相同的项,因此它们的路径可能部分重叠,路径相互重叠越多,使用FP树结构获得的压缩效果越好。
    为构建FP树,需要对原始数据集扫描两遍。
① 第一遍对所有元素项的出现次数进行计数,丢弃支持度小于阈值的非频繁项,得到频繁项集,并对频繁项集按照支持度的递减排序。
② 第二遍扫描时,构建FP树。从空集开始,依次读入排序好的频繁项集中各条事务。如果树中已存在现有元素,则增加现有元素的值;如果现有元素不存在,则向树添加一个分枝。
例1
数据集如下(需满足的最小支持度计数为3):

事务ID 事务中的元素项
001 r,z,h,j,p
002 z,y,x,w,v,u,t,s
003 z
004 r,x,n,o,s
005 y,r,x,z,q,t,p
006 y,z,x,e,q,s,t,m

① 对数据集进行第一次扫描,丢弃支持度小于3的非频繁项,得到频繁项集,并对频繁项集按照支持度计数的递减排序,得
(计算支持度计数得要丢弃的非频繁项是:h,j,p,w,v,u,n,o,q,e,m)

事务ID 过滤后的元素 重排序后的元素
001 r,z z(5),r(3)
002 z,y,x,t,s z(5),x(4),y(3),t(3),s(3)
003 z z(5)
004 r,x,s x(4),r(3),s(3)
005 y,r,x,z,t z(5),x(4),y(3),r(3),t(3)
006 y,z,x,s,t z(5),x(4),y(3),s(3),t(3)

② 对数据集进行第二次扫描,构建FP树。
这里写图片描述



三、从FP树中挖掘频繁项集

    从FP树中抽取频繁项集的三个基本步骤如下:
① 从FP树中获取前缀路径(prefix path)
    一条前缀路径是介于所查找元素项与树根节点之间的所有内容。为了获得这些前缀路径,可以对树进行穷举式搜索,直到获得想要的频繁项为止,或者使用一个更有效的方法来加速搜索过程。可以利用先前创建的头指针表来得到一种更有效的方法,头指针表包含相同类型元素链表的起始指针,一旦到达了每一个元素项,就可以上溯这棵树直到根节点为止。
② 将前缀路径转化为条件FP树(conditional FP-tree)
    对于每一个频繁项,都要创建一棵条件FP树,条件FP树的结构与FP树类似。先对单个元素构建条件FP树(即删除前缀路径中支持度计数小于阈值的树),再对剩下的元素与单个元素两两组合构建新的条件FP树,递归直至条件FP树为空。
例2
挖掘例1中数据的频繁项集
① 获取前缀路径
先创建头指针表及FP树,得到如下所示数据结构
这里写图片描述
以 t 为例,上图从左往右寻找第一个 t ,通过上溯到根节点可以获取第一个前缀路径为{s,y,x,z},接着利用头指针表寻找下一个 t ,再上溯到根节点可以获取第二个前缀路径为{r,y,x,z}。
每个频繁项的前缀路径如下:

频繁项 前缀路径(数字为支持度计数)
z {}5
r {z}1,{y,x,z}1,{s,x}1
x {z}3,{}1
y {x,z}3
s {y,x,z}2,{x}1
t {s,y,x,z}2,{r,y,x,z}1

② 创建条件FP树
以 t 为例:
用{t}为结尾项,先计数各支持度计数,再去掉计数值小于3的项,得到条件FP树如下图最右所示
这里写图片描述
用循环分别用{x,t}{y,t}{z,t}为结尾项构建条件FP树,直至构建的条件FP树为空。




四、代码实现(python)

以下代码来自Peter Harrington《Machine Learing in Action》
代码如下(保存为fpGrowth.py):

# -- coding: utf-8 --
class treeNode:
    # FP树中节点的类定义,用于构建FP树
    def __init__(self, nameValue, numOccur, parentNode):
        self.name = nameValue       # 节点名字
        self.count = numOccur       # 计数值
        self.nodeLink = None        # 链接相似的元素项
        self.parent = parentNode    # 指向当前节点的父节点
        self.children = {}          # 存放节点的子节点

    def inc(self, numOccur):
        # 对count变量增加给定值
        self.count += numOccur

    def disp(self, ind=1):
        # 用于将树以文本形式显示
        print '  '*ind, self.name, ' ', self.count
        for child in self.children.values():
            child.disp(ind+1)

def loadSimpDat():
    # 数据集
    simpDat = [['r', 'z', 'h', 'j', 'p'],
               ['z', 'y', 'x', 'w', 'v', 'u', 't', 's'],
               ['z'],
               ['r', 'x', 'n', 'o', 's'],
               ['y', 'r', 'x', 'z', 'q', 't', 'p'],
               ['y', 'z', 'x', 'e', 'q', 's', 't', 'm']]
    return simpDat

def createInitSet(dataSet):
    # 对数据集进行格式化处理
    retDict = {}
    for trans in dataSet:
        retDict[frozenset(trans)] = 1
    return retDict

def createTree(dataSet, minSup=1):
    # 该函数用于创建FP树
    # 该函数接收两个参数,分别是格式化后的数据集和需满足的最小支持度计数
    headerTable = {}                                # 存储头指针
    for trans in dataSet:
        # 循环每一个事务
        for item in trans:
            # 循环事务中的每一个元素,存储各元素的支持度计数
            headerTable[item] = headerTable.get(item, 0) + dataSet[trans]
    # 移除不满足最小支持度计数的元素项
    for k in headerTable.keys():
        if headerTable[k] < minSup:
            del(headerTable[k])
    freqItemSet = set(headerTable.keys())           # 存储删除后的元素项,即频繁项
    if len(freqItemSet) == 0: return None, None     # 如果没有元素项满足要求,则退出
    # 对头指针表扩展,以便可以保存计数值及指向每种类型第一个元素项的指针
    for k in headerTable:
        headerTable[k] = [headerTable[k], None]
    retTree = treeNode('Null Set', 1, None)         # 创建只包含空集合的根节点
    for tranSet, count in dataSet.items():          # 第二次遍历数据集,tranSet为各事务,count为初始化的计数值
        localD = {}
        for item in tranSet:
            if item in freqItemSet:                 # 如果该元素项为频繁项,则可继续操作
                localD[item] = headerTable[item][0] # 将第一次遍历得到的支持度计数赋值給相应元素
        if len(localD) > 0:
            orderedItems = [v[0] for v in sorted(localD.items(), key=lambda p: p[1], reverse=True)] # 获取元素项,并按支持度计数高到低排序
            updateTree(orderedItems, retTree, headerTable, count)
    return retTree, headerTable

def updateTree(items, inTree, headerTable, count):
    # 该函数接收4个参数,分别为已排序好的元素项、FP树、头指针表、对应计数值
    if items[0] in inTree.children:
        # 如果该元素是作为子节点存在,则更新该元素的计数
        inTree.children[items[0]].inc(count)
    else:
        # 否则,创建一个新的treeNode并将其作为一个字节点添加到树中
        inTree.children[items[0]] = treeNode(items[0], count, inTree)
        if headerTable[items[0]][1] == None:
            # 若头指针为空,更新头指针为树的子节点
            headerTable[items[0]][1] = inTree.children[items[0]]
        else:
            # 若头指针有值,更新头指针的nodeLink
            updateHeader(headerTable[items[0]][1], inTree.children[items[0]])
    if len(items) > 1:
        # 对剩下的元素进行迭代调用自身
        updateTree(items[1::], inTree.children[items[0]], headerTable, count)

def updateHeader(nodeToTest, targetNode):
    # 该函数用于更新头指针
    # 该函数接收2个参数,分别是待更新的位置和需更新的值
    while (nodeToTest.nodeLink != None):
        nodeToTest = nodeToTest.nodeLink           # 循环至链表尾端为None
    nodeToTest.nodeLink = targetNode

def ascendTree(leafNode, prefixPath):
    # 该函数用于递归上溯整颗树
    if leafNode.parent != None:
        prefixPath.append(leafNode.name)
        ascendTree(leafNode.parent, prefixPath)

def findPrefixPath(basePat, treeNode):
    # 该函数用于为给定元素项生成一个前缀路径
    # 该函数接收2个参数,分别是给定元素项和头指针表纪录的该元素的相似项路径
    condPats = {}
    while treeNode != None:
        prefixPath = []
        ascendTree(treeNode, prefixPath)
        if len(prefixPath) > 1:
            condPats[frozenset(prefixPath[1:])] = treeNode.count
        treeNode = treeNode.nodeLink
    return condPats

def mineTree(inTree, headerTable, minSup, preFix, freqItemList):
    # 该函数用于将前缀路径转化为条件FP树
    # 该函数接收5个参数,分别是FP树、头指针表、需满足最小支持度计数、前缀路径、频繁项集
    bigL = [v[0] for v in sorted(headerTable.items(), key=lambda p: p[1])]  # 将频繁1-项集的元素按支持度计数低到高排序
    for basePat in bigL:
        newFreqSet = preFix.copy()
        newFreqSet.add(basePat)
        freqItemList.append(newFreqSet)
        condPattBases = findPrefixPath(basePat, headerTable[basePat][1])    # 获取basePat的前缀路径
        myCondTree, myHead = createTree(condPattBases, minSup)              # 根据给定的前缀路径构建FP树
        if myHead != None:
            # 递归直到该元素的前缀路径为空
            print 'conditonal tree for:', newFreqSet
            myCondTree.disp(1)
            mineTree(myCondTree, myHead, minSup, newFreqSet, freqItemList)

运行命令如下:
这里写图片描述









以上全部内容参考书籍如下:
《数据挖掘导论(完整版)》人民邮电出版社
Peter Harrington《Machine Learing in Action》

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