Ubuntu 16.04 LTS 安装R及RStudio Server

16.04 LTS 安装R及RStudio Server

1.R的安装

1.1首先添加镜像源

# Ctrl+Alt+T打开终端
$ sudo gedit /etc/apt/sources.list
# 加入新镜像源 回车之后会自动跳出一个文本框，然后在相似的地方输入
deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/

加载镜像源还可以使用以下方法：

deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu xenial/
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu wily/
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu trusty/
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu precise/
or in your /etc/apt/sources.list file, replacing by the actual URL of your favorite CRAN mirror. See 
https://cran.r-project.org/mirrors.html for the list of CRAN mirrors. 

修改后保存并退出（File→quit）

1.2 运行命令下载公钥

# 下载公钥
$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9
# 然后更新一下
$ sudo apt-get update

1.3 安装R

$ sudo apt-get install r-base

然后验证是否安装成功：在终端输入R，出现R的信息则安装成功。

1.4 其他

一些可用的包存储在CRAN的Ubuntu仓库中，包括：

    r-cran-boot
    r-cran-class
    r-cran-cluster
    r-cran-codetools
    r-cran-foreign
    r-cran-kernsmooth
    r-cran-lattice
    r-cran-mass
    r-cran-matrix
    r-cran-mgcv
    r-cran-nlme
    r-cran-nnet
    r-cran-rpart
    r-cran-spatial
    r-cran-survival
    r-cran-rodbc 

要更新以上的包，可以使用下面的命令（替换掉foo）：

$ sudo apt-get build-dep r-cran-foo

R包的安装：

# 安装包
> install.packages()
# 更新包
> update.packages(lib.loc = "/usr/local/lib/R/site-library")

2. 安装Rstudio

2.1 安装

首先，去下载对应自己系统的安装文件: http://www.rstudio.com/products/rstudio/download/，然后执行一下步骤。

$ sudo apt-get install gdebi-core
$ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.99.902-amd64.deb
$ sudo gdebi rstudio-server-0.99.902-amd64.deb

2.2 启动Rstudio server

在浏览器中输入地址和端口，如：

http://192.168.43.129:8787
http://localhost:8787

然后会出现要求输入用户名和密码，这跟登录Ubuntu时候使用的用户和密码相同

登录后是这样的：

2.3在Rstudio server里安装ggplot2

安装ggplot2包之前需要先安装其它的依赖包：' plyr ' , ' digest ' , ' gtable ' , ' reshape2 ' , ' scales ' , ' proto ' , 在Rstudio的命令窗口分别执行以下命令：

install.packages('plyr')
install.packages('digest')
install.packages('gtable')
install.packages('reshape2')
install.packages('scales')
install.packages('proto')

然后，安装ggplot2包：

install.packages('ggplot2')

 参考：

https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/

https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/

https://bookdown.org/yihui/r-ninja/setup.html#r