# ITS
ATCATTA| → → →
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# LSU
TAACAAGG|TCCCC → → →
← ← ← GAAGAAGCC|笨办法，仅供参考，后续会有更新！！
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ITS
ITS5（正向）ITS4（反向）序列较短，一般可不用进行序列反向互补和序列比对，若出现套峰则要进行序列反向互补和序列比对。
用snapgene打开ab1文件，用记事本打开seq文件。
如下峰图，其碱基序列可直接使用
如下峰图（双峰叠加），需人工读峰图
如下峰图，其碱基序列直接舍弃
在看峰图的同时与如下序列进行比对，修改。
#在测序质量较好的情况下可直接用ITS5进行序列修改和blast。若要更为严谨，可使用ITS4和ITS5两者结合的方式进行比对（如下文中的LSU比对教程)。
编辑测序所得原始碱基序列
# ITS
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LSU
LR0R（正向）LR7（反向）序列较长，需要进行序列反向互补和序列比对。
用snapgene打开ab1文件，用记事本打开seq文件。
如下峰图，其碱基序列可直接使用
如下峰图（双峰叠加），需人工读峰图
如下峰图，其碱基序列直接舍弃
在看峰图的同时与如下序列进行比对，修改。
LR7（反向）的ab1文件拖入chromas软件
点击edit中的reverse+complement
序列反向互补如下
复制上图（鼠标放在图中，ctrl+C），粘贴（ctrl+V）到LR0R所在的seq文件，入下图
删去反向互补序列间的空格，如下图
如下图，添加“>”，保存。
把上述文件拖入到bioedit，如下图
出现下图界面
选择accessory application中的clustalw multiple alignment选项
点击run clustalw，再点击ok。
出现如图界面，如图点击。
根据上图用ctrl+F查找，将序列修剪拼接，如下图
编辑测序所得原始碱基序列
# LSU
TAACAAGG|TCCCC → → →
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