在线作图|如何绘制一张好看相关性矩阵图

相关性热图/矩阵

相关性分析是指对两个或者多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的密切关注程度。相关性分析通过计算两种或多种因子之间的相关性(Spearman、Pearson、Kendall’Tau等系数),将获得的数值矩阵通过热图或矩阵直观展示。相关性热图/矩阵在组学分析中运用广泛,如基因的共表达分析、微生物群落的共发生网络分析、样本的重复检验等等。
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图形含义

相关性系数矩阵图:如根据微生物丰度的变化以及环境因子数据,进行两者间的相关分析(下面主要展示下三角矩阵)
①颜色变化反应二维矩阵或表格中的数据信息;
②蓝色表示正相关性,红色表示负相关性;颜色深浅表示系数值的大小,颜色越深,相关性越强,如圆点颜色越蓝,表示相关性系数越接近1,颜色越红,表示系数越接近-1;
③圆点越大,表示两个变量之间的相关性系数越大;
④如果相关性P值大于0.05,则无圆圈展示。
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TUTU云工具绘制相关性热图/矩阵

小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(https://ww.cloudtutu.com/#/index,免费的哦~),操作步骤如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录,不必注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏里找到相关性热图2,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作。

Step 1 上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据);
b)表格需要带表头和列名,每一行为样本名,每一列为各种指标数据名,例如环境影响因子名称等等;
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事
本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。
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Step 2 设置参数
2.1 显著性符号:按需自行选择
显示所有p值;
显著标记*;
显示不显著的点的P值;
不显著的点为空;
P值大于0.5的点显示为x;
不显示
2.2 计算方法:本平台提供计算pearson、等三种相关系数的选择
pearson,皮尔逊相关性系数,用来衡量定距定量间的线性关系,分析数据需符合连续、正态分布、线性关系等条件。
spearman,通常称“斯皮尔曼秩相关性系数”,是衡量两个变量的依赖性的非参数指标,用于专门分析顺序数据;同时也是等级相关系数,其值与两个相关变量的具体值无关,而仅仅与其值之间的大小关系有关。
kendall,肯得尔相关性系数,是一种等级相关性系数,它所及计算的对象是分类变量。
3.3 图片样式:全、下三角、上三角

Step 3 下载文件

根据个人需求进行参数调整后点击运行后等待5-10秒即可下载结果,平台提供PDF格式的矢量图下载。

Step 4 作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件(Inkscape或AI)进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编微信获取。

Step 5 写作建议

XXXX analysis was performed on Tutools platform (http://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.
尊敬的用户,如果图图云平台在您的科研中有幸提供了些许帮助,我们期望您能在方法学或者致谢中提及我们,引用方法如下:XXXX analysis was performed on Tutools platform (http://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website. 目前平台还处于测试阶段,使用过程中有任何疑问或者报错欢迎随时联系小编反馈。您的反馈和建议是我们最大的动力~
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