其根本在于两个理论的数学基础，物理意义和哲学世界观都有着很大的分歧。
数学基础
广义相对论是无限可分、连续性的。
量子论是不连续性的, 是离散的、量子化的，有最小单位的。
物理意义
广义相对论是经典确定理论，由状态A可以推论出确定的，唯一的状态B。
量子论是不确定性的，由状态A到状态B是不可预知的，是随机的概率过程。
哲学世界观
广义相对论描述的世界是客观实在性的，宇宙与观测者严格区分开,在观测过程中观测者发现了世界。（唯物）
量子论描述的世界是主观能动性的，宇宙与观测者你中有我，我中有你,在观测过程中观测者改变和创造了世界。（唯心）
形象一点讲就是：
广义相对论描述的是一个美丽，庄严的“和谐”世界。
量子论描述的是一个激情，奔放的“自由”世界。