安装所需包
sudo su #开启管理员模式，输入密码后继续
apt-get install gcc #安装gcc
apt-get install g++ #安装g++
apt-get install gfortran #安装gfortran
apt-get install make #安装make
下载所需文件
在home目录下打开终端：
#新建lammps文件夹
mkdir lammps
#进入lammps
cd lammps
#下载fftw-3.3.8.tar.gz
wget http://www.fftw.org/fftw-3.3.8.tar.gz
#下载mpich-3.3.2.tar.gz
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.3.2/mpich-3.3.2.tar.gz
#下载lammps-stable.tar.gz
wget https://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz
解压
#解压后为fftw-3.3.8
tar -xvf fftw-3.3.8.tar.gz
#解压后为mpich-3.3.2
tar -xvf mpich-3.3.2.tar.gz
#解压后为lammps-3Mar20
tar -xvf lammps-stable.tar.gz
安装fftw
进入/lammps-3Mar20/src/MAKE/OPTIONS路径下，从Makefile.fftw文件可知lammps默认fftw调用路径为/usr/local，为了后续编译lammps方便，将fftw安装到此路径下。
cd lammps/src/MAKE/OPTIONS
vim Makefile.fftw
cd fftw-3.3.8
sudo ./configure --prefix=/usr/local --enable-float
./configure --prefix=/usr的解释
Linux ./configure --prefix命令
sudo make -j #-j意为调用编译无核数限制
sudo make install #凡事sudo就完事儿了，我之前没sudo出过问题
cd #返回根目录
安装MPICH
进入\lammps-3Mar20\src\MAKE\OPTIONS路径，打开Makefile.g++_mpich_link文件，通过查看以下内容可知lammps默认mpich调用路径为/usr/local。
cd lammps/mpich-3.3.2
sudo ./configure --prefix=/usr/local
sudo make -j
sudo make install
cd .. #返回上级目录
安装lammps
cd lammps/lammps-3Mar20/src
sudo make mpi -j
成功的话会生成lmp_mpi的文件
注意：lammps默认安装3个依赖包，MANYBODY，KSPACE，MOLECULE。如果还有其它依赖包需要，只需要在/lammps-3Mar20/src 文件夹下分别输入指令：
1. make package-status（查看依赖包状态）
2. make yes-***（安装***依赖包）
3. make no-***（删除***依赖包）
4. make mpi -j
重新生成可执行文件lmp_mpi就可
注意：不要make yes-all，会卡住。。。根据自己需求的package安装即可，初次安装我就加了MANYBODY, KSPACE, MOLECULE这三个包:
make yes-MANYBODY
make yes-KSPACE
make yes-MOLECULE
sudo make mpi -j
测试
#返回根目录
cd
#进入shear文件夹
cd lammps/lammps-3Mar20/examples/shear
#
vi in.shear
取消注释：#dump 1 all atom 100 dump.shear，保存退出后运行测试
/usr/local/bin/mpirun -np 6 /home/yuabaoqiang/lammps/lammps-3Mar20/src/lmp_mpi < in.shear
- mpirun在/usr/local/bin下
- 6是我的核数
- lmp_mpi在/home/yuabaoqiang/lammps/lammps-3Mar20/src下
- in.shear为我的in文件
运行界面：
dump文件：
为了简化运行命令，可以将运行文件所在的文件夹写入PATH路径
桌面打开终端：
vi .bashrc
直接在最下面添加文本：
注意文件路径书写根据自己实际情况来。
export PATH=/usr/local/bin:/usr/local/lib:/usr/local/include:/home/yuanbaoqiang/lammps/lammps-3Mar20/src:$PATH
#使环境生效
source .bashrc
再次测试
cd lammps/lammps-3Mar20/examples/shear
mpirun -np 6 lmp_mpi < in.shear
然后完美运行～
参考：
网上帖子有很多，但其实都差不多，大家可以参考多个版本，最后选择适合自己的。
