Spark合并输出小文件

  在Spark SQL执行etl时候会有最终结果大小只有几百k,但是小文件一个分区有上千的情况。危害:

  1. HDFS有最大文件数限制
  2. 浪费磁盘资源(可能存在空文件)
  3. Hive中进行统计,计算的时候,会产生很多个map,影响计算的速度

方法一:通过spark的coalesce()方法和repartition()方法

val rdd2 = rdd1.coalesce(8, true)true表示是否shuffle)
val rdd3 = rdd1.repartition(8)

说明:
  coalesce:coalesce()方法的作用是返回指定一个新的指定分区的Rdd,如果是生成一个窄依赖的结果,那么可以不发生shuffle,
分区的数量发生激烈的变化,计算节点不足,不设置true可能会出错。repartition:coalesce()方法shuffle为true的情况。

方法二:降低spark并行度,即调节spark.sql.shuffle.partitions
  比如之前设置的为100,按理说应该生成的文件数为100;
但是由于业务比较特殊,采用的大量的union all,且union all在spark中属于窄依赖,不会进行shuffle,所以导致最终会生成(union all数量+1)*100的文件数。如有10个union all,会生成1100个小文件。这样导致降低并行度为10之后,执行时长大大增加,且文件数依旧有110个,效果有,但是不理想。

方法三:新增一个并行度=1任务,专门合并小文件。
  先将原来的任务数据写到一个临时分区(如tmp);再起一个并行度为1的任务,类似:insert overwrite 目标表 select * from 临时分区 但是结果小文件数还是没有减少,略感疑惑;
经过多次测后发现原因:‘select * from 临时分区’ 这个任务在spark中属于窄依赖;并且spark DAG中分为宽依赖和窄依赖,只有宽依赖会进行shuffle;故并行度shuffle,spark.sql.shuffle.partitions=1也就没有起到作用;由于数据量本身不是特别大,所以直接采用了group by(在spark中属于宽依赖)的方式,类似:insert overwrite 目标表 select * from 临时分区 group by * 先运行原任务,写到tmp分区,‘dfs -count’查看文件数,1100个,运行加上group by的临时任务(spark.sql.shuffle.partitions=1),查看结果目录,文件数=1,成功。最后又加了个删除tmp分区的任务。

  针对以上三种情况:

  1. 可以采用coalesce()方法和repartition()方法
  2. 如果任务逻辑简单,数据量少,可以直接降低并行度
  3. 任务逻辑复杂,数据量很大,原任务大并行度计算写到临时分区,再加两个任务:一个用来将临时分区的文件用小并行度(加宽依赖)合并成少量文件到实际分区;另一个删除临时分区
  4. hive任务减少小文件相对比较简单,可以直接设置参数,如:
Map-only的任务结束时合并小文件:
sethive.merge.mapfiles = true

在Map-Reduce的任务结束时合并小文件:
sethive.merge.mapredfiles= true

当输出文件的平均大小小于1GB时,启动一个独立的map-reduce任务进行文件merge:
sethive.merge.smallfiles.avgsize=1024000000
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