Spark(二十九)troubleshooting之解决JVM GC导致的shuffle文件拉取失败

一、背景

1、比如,executor的JVM进程,可能内存不是很够用了。那么此时可能就会执行GC。minor GC or full GC。总之一旦发生了JVM之后,就会导致executor内,所有的工作线程全部停止,比如BlockManager,基于netty的网络通信。

2、下一个stage的executor,可能是还没有停止掉的,task想要去上一个stage的task所在的exeuctor,去拉取属于自己的数据,结果由于对方正在gc,就导致拉取了半天没有拉取到。

3、就很可能会报出,shuffle file not found。但是,可能下一个stage又重新提交了stage或task以后,再执行就没有问题了,因为可能第二次就没有碰到JVM在gc了。

流程图解

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  • Qestion:有时会出现的一种情况,非常普遍,在spark的作业中;shuffle file not found。
    1、(spark作业中,非常非常常见的)而且,有的时候,它是偶尔才会出现的一种情况。有的时候,出现这种情况以后,会重新去提交stage、task。重新执行一遍,发现就好了。没有这种错误了。

2、log怎么看?用client模式去提交你的spark作业。比如standalone client;yarn client。一提交作业,直接可以在本地看到刷刷刷更新的log。

  • Answer

1、spark.shuffle.io.maxRetries 3

第一个参数,意思就是说,shuffle文件拉取的时候,如果没有拉取到(拉取失败),最多或重试几次(会重新拉取几次文件),默认是3次。

2、spark.shuffle.io.retryWait 5s

第二个参数,意思就是说,每一次重试拉取文件的时间间隔,默认是5s钟。

3、默认情况下,假如说第一个stage的executor正在进行漫长的full gc。第二个stage的executor尝试去拉取文件,结果没有拉取到,默认情况下,会反复重试拉取3次,每次间隔是五秒钟。最多只会等待3 * 5s = 15s。如果15s内,没有拉取到shuffle file。就会报出shuffle file not found。

4、针对这种情况,我们完全可以进行预备性的参数调节。增大上述两个参数的值,达到比较大的一个值,尽量保证第二个stage的task,一定能够拉取到上一个stage的输出文件。避免报shuffle file not found。然后可能会重新提交stage和task去执行。那样反而对性能也不好。

5、spark.shuffle.io.maxRetries 60
spark.shuffle.io.retryWait 60s

6、最多可以忍受1个小时没有拉取到shuffle file。只是去设置一个最大的可能的值。full gc不可能1个小时都没结束吧。
这样呢,就可以尽量避免因为gc导致的shuffle file not found,无法拉取到的问题。

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