Gromacs读取二进制文件转化为可读十进制文件

版权声明： https://blog.csdn.net/qq_36170511/article/details/85273890

近来用GROMACS做简正模式分析（NMA）,做完之后，想做后续工作需要用到Hessian矩阵和特征值和特征向量。但是GMX输出的特征值是十进制格式，输出的Hessian(.mtx)和特征向量(.trr)都是二进制文件，无法直接读出。

结果花了好多天的力气，曾试图改GMX底层代码，看了好多天他的c文件，结果头大。无奈又翻了几遍手册，发现居然有专门读取GMX二进制文件的命令~

具体操作如下

gromacs 4.5版本 gmxdump -f xxx.trr -om xxx.mdp >>xxx.txt 

gromacs 5+版本 gmx dump -f xxx.trr -om xxx.mdp >>xxx.txt

这里如果不加上>>后边的这段，仅仅是写上xxx.mdp，是不会输出任何文件。我也不清楚为啥，只有将它转化为txt才有输出