plyr包
apply把一个function作用到array或者matrix的margins（可以理解为数组的每一行或者每一列）中，返回值时vector、array、list。
简单的说，apply函数经常用来计算矩阵中行或列的均值、和值的函数.
apply(data.frame,1,fun())上面的指令代表对矩阵b进行行计算，分别对每一行进行求和。函数涉及了三个参数：
第一个参数是指要参与计算的矩阵；
第二个参数是指按行计算还是按列计算，1——表示按行计算，2——按列计算；
第三个参数是指具体的运算参数。
plyr包属于R base packages。
XXply
第一个字母表示函数应用的对象类型，第二个字母表示函数返回值的对象类型，
字母取值有：
a: array
l: list
d: data.frame
m: multiple inputs
r: repeat multiple times
plyr包的ddply函数
第1个参数，输入数据，类型为数据框(data frame)
第2个参数，变量或者多个变量，数据框的分组字段
第3个参数，分组函数，对分组后的子集上进行计算
library(plyr)
ddply(iris, .(Species), function(x) colMeans(x[-5]))
ddply(iris, .(Species), colwise(sum))colwise
colwise：将对vector的操作函数转换成对df中column的操作函数
操作离散数值变量
catcolwise：
numcolwise：
二、函数tapply（进行分组统计）：
使用格式为：
tapply(X, INDEX, FUN = NULL, ..., simplify = TRUE)
其中X通常是一向量；INDEX是一个list对象，且该list中的每一个元素都是与X有同样长度的因子；FUN是需要计算的函数；simplify是逻辑变量，若取值为TRUE（默认值），且函数FUN的计算结果总是为一个标量值，那么函数tapply返回一个数组；若取值为FALSE，则函数tapply的返回值为一个list对象。需要注意的是，当第二个参数INDEX不是因子时，函数 tapply() 同样有效，因为必要时 R 会用 as.factor()把参数强制转换成因子。
参考： https://www.cnblogs.com/nanhao/p/6674063.html
https://www.zhihu.com/question/39843392