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conda使用
这里已经在centos7下安装好了Anaconda。在Anaconda安装中需要注意与python版本的对应。
帮助信息
查看conda帮助
conda -V #查看版本信息
conda -h #获取帮助
#查看conda某命令的帮助
conda upgrade -h
conda create -h
conda remove -h
管理conda和anaconda
conda info #查看conda信息
conda update conda #升级conda
conda update anaconda #升级anaconda
添加conda三方源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes ## 设置搜索时显示通道地址
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --get channels #查看已添加的channels
包管理
conda search fastqc #查看库软件版本
conda install fastqc=0.11.7 #安装指定版本软件 #会卸载之前的版本重新安装
conda update fastqc #更新版本
conda remove fastqc #卸载软件
环境管理
conda env -h #查看环境管理的全部命令
conda info -e #环境信息
conda create -n test python=2.7 #创建环境test，并指定python版本，此例为2.7
source activate test #激活环境
source deactivate test #关闭环境
conda remove --name test --all #删除环境