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R语言：对R包进行unit testing
Bioconductor给的官方unite testing介绍：
BioC-unite testing
这个介绍写了三件事：
- how to write unit tests
- how to run them
- how they are woven into the standard Bioconductor build process
推荐使用两个package之一进行测试：RUnit和testthat，这里我选testthat。
下面是testthat的开发者Hadley Wickham写的文档和文章，此人还开发了ggplot。
testthat-文档
testthat-文章
是用testthat工具做unit test真的特别简单。在console输入代码：
devtools::use_testthat()
它会帮你：
- 创建一个tests/testthat的文件路径
- 在DESCRIPTION中添加一句：Suggests: testthat
- 创建一个tests/testthat.R文件
然后你需要在tests/testthat下面创建R scrip文件，以test开头即可。然后在这个文件中，模仿下面的代码写unit tests，
代码内容是测试package stringr里面的str_length()函数。
context("String length")
library(stringr)
test_that("str_length is number of characters", {
expect_equal(str_length("a"), 1)
expect_equal(str_length("ab"), 2)
expect_equal(str_length("abc"), 3)
})
简单来说，就是先写前两行代码，第一行给这个测试命名，第二行导入你的package，然后使用test_that()函数，这个函数的用法，在Hadley Wickham有详细介绍。
写完后用cmd/control + shift + T 或者在console输入：
devtools::test()
来进行测试。
下图是我的测试结果：
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