这个坑我遇到了两次了，所以就写下来以防自己再遇到。
第一次没看conscole，所以就不知道具体原因是什么。
第二次留意了conscole
Djava.endorsed.dirs=D:\Tomcat 9.0\endorsed is not supported.
Endorsed standards and standalone APIsin modular form will be supported via the concept of upgradeable modules.
第一次整整弄了一个下午，最后通过降级jdk版本到1.8解决掉。
第二次就在想每一次新建工作空间都像第一次这样过于麻烦。因为命令行启动tomcat是没有问题的，所以猜测应该是eclipse的问题。解决方法：
1.eclipse--Window--Preferences--Install/update--Available Software Sites，将The Eclipse Web Tools Platform的location后缀的neon改成oxygen。
2.help--check for update，等待重启。
3.Run--Run Configurations--Apache Tomcat--Tomcat v9.0 Server--Arguments--VM arguments，将参数最后的-Djava.endorsed.dirs="D:\java\tomcat\apache-tomcat-9.0.10\endorsed删除掉，Apply然后再Start Tomcat就好了。
第二次的解决方法部分来自https://bbs.csdn.net/topics/392277991中的12楼的层主Ice2017，谢谢了。
为什么说部分呢，因为我是在更新WTP之后再修改设置的（因为练习的项目涉及到JSTL库，所以之前更新了），Ice是修改设置之后再更新WTP的。