一、文件系统
文件系统是操作系统用于明确存储设备或分区上的文件的方法和数据结构，即在存储设备上组织文件的方法。文件系统由三部分组成：文件系统的接口，对对象操纵和管理的软件集合，对象及属性。Windows系统下常见的文件系统是NTFS和FAT。
二、NTFS和FAT
NTFS文件系统是一个基于安全性的文件系统，是Windows NT所采用的独特的文件系统结构，它是建立在保护文件和目录数据基础上，同时照顾节省存储资源、减少磁盘占用量的一种先进的文件系统。
对于FAT文件系统来讲，目前比较流行的是FAT32，FAT32文件系统可以重新定位根目录和使用FAT的备份副本。另外FAT32分区的启动记录被包含在一个含有关键数据的结构中，减少了计算机,系统崩溃的可能性。并且FAT32的存储效率要比FAT16高很多。
三、NTFS和FAT之间的区别
1、磁盘分区容量
NTFS可以支持的分区(如果采用动态磁盘则称为卷)大小可以达到2TB（2048GB）,而Windows 2000中的FAT32支持分区的大小最大为32GB。
2、单个文件容量
FAT32在实际运行中不支持单个文件大于4GB的文件，一旦超过容量限制那么系统就会提示磁盘空间不足。NTFS就目前来说已经突破了单个文件4GB的容量限制，目前来说似乎没容量限制，只要硬盘空间容量有多大，那么就NTFS就可以分到多大。因为现在的很多应用程序以及游戏大作都超过了4GB容量，因此用户必须将大程序安装的磁盘改成NTFS格式。
3、安全
FAT32文件安全设置：不支持；NTFS文件安全设置：支持
4、磁盘管理
在Win 2000的FAT32文件系统的情况下，分区大小在2GB～8GB时簇的大小为4KB；分区大小在8GB～16GB时簇的大小为8KB；分区大小在16GB～32GB时，簇的大小则达到了16KB。而Win 2000的NTFS文件系统，当分区的大小在2GB以下时，簇的大小都比相应的FAT32簇小；当分区的大小在2GB以上时（2GB～2TB），簇的大小都为4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盘空间，最大限度地避免了磁盘空间的浪费。
5、应用
一般电脑硬盘等大容量的存储设备的文件系统格式都是NTFS；U盘、内存卡等小型存储设备的文件系统格式则是FAT。