InnoDB和MyISAM的区别
1. 存储结构
MyISAM：索引和数据的文件分开存储，每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件。
InnoDB：索引和数据绑在一起，所有的表都保存在同一个数据文件中（也可能是多个文件，或者是独立的表空间文件），InnoDB表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般为2GB。
2. 存储空间
MyISAM：可以压缩，存储空间小。静态表、动态表、压缩表。
InnoDB：需要更多的内存和存储，它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。
3. 可移植性，备份恢复
MyISAM：数据以文件形式存储，跨平台移植方便。
InnoDB：要将数据备份成.sql文件，数据量大的话就麻烦。
4. 事务支持
MyISAM：不支持事务，因为要求高性能，每个查询都是原子性，比InnoDB快。
InnoDB：支持事务、外键和崩溃恢复功能。
5. auto_incremant
6. 锁
MyISAM：表锁，用户在操作myisam表时，select，update，delete，insert语句都会给表自动加锁，如果加锁以后的表满足insert并发的情况下，可以在表的尾部插入新的数据。
InnoDB：行锁，大幅度提高了多用户并发操作的新能。但是InnoDB的行锁，只是在WHERE的主键是有效的，非主键的WHERE都会锁全表的。对索引加锁，而不是对数据加锁。
7. 全文索引
MyISAM：支持全文索引。
InnoDB：不支持全文索引，但是innodb可以使用sphinx插件支持全文索引，并且效果更好。
8. 主键
MyISAM：可以允许没有索引和主键，索引都是保存地址。
InnoDB：如果没有设定主键或者非空唯一索引，就会自动生成一个6字节的主键(用户不可见)，数据是主索引的一部分，附加索引保存的是主索引的值。
9. 表的具体行数
MyISAM：记录表的行数，select count(*) 时会直接取出记录。
InnoDB：不记录表的行数，select count(*) 时会遍历所有表。
10. 增删改查
MyISAM：如果执行大量的select，用MyISAM会更好。
InnoDB：如果大量insert、update，应考虑InnoDB；至于删除InnoDB也更好，但DELETE FROM table时，InnoDB不会重新建立表，而是一行一行的删除，在innodb上如果要清空保存有大量数据的表，最好使用truncate table这个命令。
11. 外键
MyISAM：不支持
InnoDB：支持
参考：
http://www.jb51.net/article/62457.htm