安装之前，首先要在虚拟机（推荐VMware）上装好Ubuntu系统（推荐12.0以上版本），考虑到以后要进行磁共振数据处理，建议预留给他硬盘空间大于60G，最好是空出一个盘专门放Ubuntu系统。我当时吃了预设硬盘空间不足的亏，所以希望安装时能注意一下。进入Ubuntu，打开终端（Ctrl+Alt+t），固定到左侧选项栏。Ubuntu指令不多说了，开始介绍Fsl安装步骤。
注意：安装Fsl之前，先打开Ubuntu的Updater进行更新。然后进行下面的步骤。
1、Fsl 网站
打开链接。
http://neuro.debian.net/install_pkg.html?p=fsl-complete
2、选择服务器
打开之后会出现如下选项：
选择应用的系统和下载服务器，并点击“only”。右侧下拉菜单中，三个China开头的都可以选。我的选择如下：
3、
在终端中输入下面指令：
wget -O- http://neuro.debian.net/lists/trusty.cn-bj1.libre | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
注意：这里有时会出现卡顿，很长时间没有反应。情况如下：
我的解决方法是，多次按回车，直到终端开始提示你输密码（这个方法有点暴力，希望还能找到别的方法）。之后出现服务器信息如下：
4、
在终端中输入下面指令：
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pgp.mit.edu:80 0xA5D32F012649A5A9
5、update
在终端中输入下面指令：
sudo apt-get update
6、安装Fsl
在终端中输入下面指令：
sudo apt-get install fsl
注意：官网原指令是“sudo apt-get install fsl-complete”，我安装时提示找不到安装包，这句指令可能有错。
7、配置环境变量
在终端输入sudo gedit /etc/bash.bashrc，在所打开的文本的最后加入
. /etc/fsl/fsl.sh
保存打开文件，并关闭。
注意：
a.“ . /”中“.”和“/”之间有空格。
b.路径填写要查看fsl.sh的所在路径。如下图所示：
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安装步骤结束，在终端中输入“Fsl”就可以开了软件了。
参考：https://blog.csdn.net/alpha_leemc/article/details/51037229
环境配置步骤：
fsl已经更新到5.0.10，在5.0这个大版本号下fsl的安装路径已经发生了改变
（http://neuro.debian.net/pkgs/fsl-complete.html）
本文的目的是指导在neurodebian上安装fsl之后的本地环境变量配置
本文默认读者会vim的操作，实在不行把vim换成其他的文本编辑器
一、
在终端中输入 sudo vim /etc/profile ，在所打开的文本的最后加入
export PATH=$PATH:/usr/share/fsl/5.0/binexport FSLDIR=/usr/share/fsl/5.0
保存文件，并关闭。
二、
再输入 sudo vim /etc/bash.bashrc ，在所打开的文本的最后加入
source $FSLDIR/etc/fslconf/fsl.sh
保存文件，并关闭。
三、
如果不想重启电脑可以:
source ~/.bashrc
最后在bash里运行fsl查看是否配置成功
查看fsl version，其实ubuntu使用的版本是5.0.8
cat $FSLDIR/etc/fslversion