怎么查看docking后的配体和哪些氨基酸连接在一起了?(氨基酸对照表)

例如上述这张图,你想知道配体和那些氨基酸连接在一起了?此时直接茶轩序号前面的三个字母就可以了,按照下面的对照表进行描述

名称 缩写 分子
分子
残基
分子式
残基分子量
(-H2O)
pKa1 pKb2 pKx3 pl4
丙氨酸 Ala A 89.10 C3H7NO2 C3H5NO 71.08 2.34 9.69 6.00
精氨酸 Arg R 174.20 C6H14N4O2 C6H12N4O 156.19 2.17 9.04 12.48 10.76
天冬酰胺 Asn N 132.12 C4H8N2O3 C4H6N2O2 114.11 2.02 8.80 5.41
天冬氨酸 Asp D 133.11 C4H7NO4 C4H5NO3 115.09 1.88 9.60 3.65 2.77
半胱氨酸 Cys C 121.16 C3H7NO2S C3H5NOS 103.15 1.96 10.28 8.18 5.07
谷氨酸 Glu E 147.13 C5H9NO4 C5H7NO3 129.12 2.19 9.67 4.25 3.22
谷氨酰胺 Gln Q 146.15 C5H10N2O3 C5H8N2O2 128.13 2.17 9.13 5.65
甘氨酸 Gly G 75.07 C2H5NO2 C2H3NO 57.05 2.34 9.60 5.97
组氨酸 His H 155.16 C6H9N3O2 C6H7N3O 137.14 1.82 9.17 6.00 7.59
羟(基)脯氨酸 Hyp O 131.13 C5H9NO3 C5H7NO2 113.11 1.82 9.65
异亮氨酸 Ile I 131.18 C6H13NO2 C6H11NO 113.16 2.36 9.60 6.02
亮氨酸 Leu L 131.18 C6H13NO2 C6H11NO 113.16 2.36 9.60 5.98
赖氨酸 Lys K 146.19 C6H14N2O2 C6H12N2O 128.18 2.18 8.95 10.53 9.74
甲硫氨酸 Met M 149.21 C5H11NO2S C5H9NOS 131.20 2.28 9.21 5.74
苯丙氨酸 Phe F 165.19 C9H11NO2 C9H9NO 147.18 1.83 9.13 5.48
脯氨酸 Pro P 115.13 C5H9NO2 C5H7NO 97.12 1.99 10.60 6.30
焦谷氨酸 Glp U 139.11 C5H7NO3 C5H5NO2 121.09 5.68
丝氨酸 Ser S 105.09 C3H7NO3 C3H5NO2 87.08 2.21 9.15 5.68
苏氨酸 Thr T 119.12 C4H9NO3 C4H7NO2 101.11 2.09 9.10 5.60
色氨酸 Trp W 204.23 C11H12N2O2 C11H10N2O 186.22 2.83 9.39 5.89
酪氨酸 Tyr Y 181.19 C9H11NO3 C9H9NO2 163.18 2.20 9.11 10.07 5.66
缬氨酸 Val V 117.15 C5H11NO2 C5H9NO 99.13 2.32 9.62 5.96

https://www.sigmaaldrich.com/HK/zh/technical-documents/technical-article/protein-biology/protein-structural-analysis/amino-acid-reference-chart

猜你喜欢

转载自blog.csdn.net/weixin_43135178/article/details/132641486