sudo -s 转到root权限
su XXX是转到自己的权限
rstudio -server start 打开rstudio的端口
locate WT1 | less 定位找到WT1这个文件,然后再打开查看一下
之前安装了R-metpeaks 这个最好打开网络端来做
首先创立一个目录用来存放结果,不然之后找不到
getwd()
setwd()
做m6A的分析:最后得到的Input文件和IP文件的last.bam文件
IP_BAM=c('last.bam文件路径')
Input_BAM=c('last.bam文件路径')
metpeak(注释文件GENE_ANNO_GTF='
路径Homo_sapiens.GRCh38.83.gtf',IP_BAM=IP_BAM,INPUT_BAM=Input_BAM,EXPERIMENT_NAME='自己创立的最终存放的文件夹')
知道是在那个基因上面