spark3.x 生产调优笔记

1 spark sql写入mysql非常慢

  • 有这样一个业务场景:需要将通过Spark处理之后的数据写入MySQL,并在在网页端进行可视化输出。Spark处理之后有大概40万条数据,写入MySQL却要耗费将近30分钟,这也太慢了!
  • 后来翻看了Spark向JDBC数据源写数据的那部分源码,虽然源码中的实现使用的确实是PreparedStatement 的addBatch()方法和executeBatch()方法,但是我们再去翻看executeBatch()方法的实现后发现,它并不是每次执行一批插入,而是循环的去执行每条insert插入语句,这就造成只插入一条数据,而不是一批数据,导致大多数的时间都耗费在了与数据库的交互连接上了
  • 解决方法:
jdbc.saas.url=jdbc:mysql://172.25.1.*/saas-hospital?characterEncoding=utf-8&useSSL=false&rewriteBatchedStatements=true

2 spark sql jdbc并发分区

  • jdbcDF.rdd.partitions.size # 结果返回 1。该操作的并发度为1,你所有的数据都会在一个partition中进行操作,意味着无论你给的资源有多少,只有一个task会执行任务,执行效率可想而之,并且在稍微大点的表中进行操作分分钟就会OOM。
def jdbc(
  url: String,
  table: String,
  columnName: String,    # 根据该字段分区,需要为整形,比如id等
  lowerBound: Long,      # 分区的下界
  upperBound: Long,      # 分区的上界
  numPartitions: Int,    # 分区的个数
  connectionProperties: Properties): DataFrame

#指定字段区间分区
val predicates =
    Array(
      "2015-09-16" -> "2015-09-30",
      "2015-10-01" -> "2015-10-15",
      "2015-10-16" -> "2015-10-31",
      "2015-11-01" -> "2015-11-14",
      "2015-11-15" -> "2015-11-30",
      "2015-12-01" -> "2015-12-15"
    ).map {
    
    
      case (start, end) =>
        s"cast(modified_time as date) >= date '$start' " + s"AND cast(modified_time as date) <= date '$end'"
    }

// 取得该表数据
val jdbcDF = sqlContext.read.jdbc(url,tableName,predicates,prop)

3 SparkSQL与Parquet格式兼容性

  • spark.sql.parquet.writeLegacyFormat 默认是false。如果设置为true 数据会以spark 1.4和更早的版本的格式写入。比如,decimal类型的值会被以apache parquet的fixed-length byte array格式写出,该格式是其他系统例如hive,impala等使用的。如果是false,会使用parquet的新版格式。例如,decimals会以int-based格式写出。

4 RDD复用并序列化存储

  • 必须对多次使用的 RDD 进行持久化,通过持久化将公共 RDD 的数据缓存到内存/磁盘中,之后对于公共 RDD 的计算都会从内存/磁盘中直接获取 RDD 数据
  • RDD 的持久化是可以进行序列化的,当内存无法将 RDD 的数据完整的进行存放的时候,可以考虑使用序列化的方式减小数据体积,将数据完整存储在内存中
    public static final StorageLevel MEMORY_ONLY_SER_2 
    public static final StorageLevel MEMORY_AND_DISK_SER_2 

5 RDD合理设置并行度

  • Spark 官方推荐,task 数量应该设置为 Spark 作业总 CPU core 数量的 2~3 倍。之所以没有推荐 task 数量与 CPU core 总数相等,是因为 task 的执行时间不同,有的 task 执行速度快而有的 task 执行速度慢,如果 task 数量与 CPU core 总数相等,那么执行快的 task 执行完成后,会出现 CPU core 空闲的情况。如果 task 数量设置为 CPU core 总数的 2~3 倍,那么一个task 执行完毕后,CPU core 会立刻执行下一个 task,降低了资源的浪费,同时提升了 Spark作业运行的效率。
val conf = new SparkConf().set("spark.default.parallelism", "500")

6 广播大变量

  • 默认情况下,task 中的算子中如果使用了外部的变量,每个 task 都会获取一份变量的复本,这就造成了内存的极大消耗。一方面,如果后续对 RDD 进行持久化,可能就无法将 RDD数据存入内存,只能写入磁盘,磁盘 IO 将会严重消耗性能;另一方面,task 在创建对象的时候,也许会发现堆内存无法存放新创建的对象,这就会导致频繁的 GC,GC 会导致工作线程停止,进而导致 Spark 暂停工作一段时间,严重影响 Spark 性能。

7 Kryo 序列化

  • Kryo 序列化机制比 Java 序列化机制性能提高 10 倍左右,Spark 之所以没有默认使用Kryo 作为序列化类库,是因为它不支持所有对象的序列化,同时 Kryo 需要用户在使用前注册需要序列化的类型,不够方便,但从 Spark 2.0.0 版本开始,简单类型、简单类型数组、字符串类型的 Shuffling RDDs 已经默认使用 Kryo 序列化方式了
public class MyKryoRegistrator implements KryoRegistrator {
    
    
	 @Override
	 public void registerClasses(Kryo kryo){
    
    
	 	kryo.register(StartupReportLogs.class);
	 }
 }

//创建 SparkConf 对象
val conf = new SparkConf().setMaster().setAppName()
//使用 Kryo 序列化库,如果要使用 Java 序列化库,需要把该行屏蔽掉
conf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer"); 
//在 Kryo 序列化库中注册自定义的类集合,如果要使用 Java 序列化库,需要把该行屏蔽掉
conf.set("spark.kryo.registrator", "MyKryoRegistrator");

8 foreachPartition 优化数据库操作

  • 在生产环境中,通常使用 foreachPartition 算子来完成数据库的写入,通过 foreachPartition算子的特性,可以优化写数据库的性能。
  • 对于我们写的 function 函数,一次处理一整个分区的数据;
  • 对于一个分区内的数据,创建唯一的数据库连接;
  • 只需要向数据库发送一次 SQL 语句和多组参数;

9 repartition 解决 SparkSQL 低并行度问题

  • Spark SQL 的并行度不允许用户自己指定,Spark SQL 自己会默认根据 hive 表对应的HDFS 文件的 split 个数自动设置 Spark SQL 所在的那个 stage 的并行度,用户自己通spark.default.parallelism 参数指定的并行度,只会在没 Spark SQL 的 stage 中生效。
  • Spark SQL 这一步的并行度和 task 数量肯定是没有办法去改变了,但是,对于Spark SQL 查询出来的 RDD,立即使用 repartition 算子,去重新进行分区,这样可以重新分区为多个 partition,从 repartition 之后的 RDD 操作,由于不再设计 Spark SQL,因此 stage 的并行度就会等于你手动设置的值,这样就避免了 Spark SQL 所在的 stage 只能用少量的 task 去处理大量数据并执行复杂的算法逻辑。
    spark sql重分区

10 reduceByKey 预聚合

  • 本地聚合后,在 map 端的数据量变少,减少了磁盘 IO,也减少了对磁盘空间的占用;
  • 本地聚合后,下一个 stage 拉取的数据量变少,减少了网络传输的数据量;
  • 本地聚合后,在 reduce 端进行数据缓存的内存占用减少;
  • 本地聚合后,在 reduce 端进行聚合的数据量减少。
  • 基于 reduceByKey 的本地聚合特征,我们应该考虑使用 reduceByKey 代替其他的 shuffle 算
    子,例如 groupByKey。

11 故障:shuffle file not found

  • 原因:Shuffle 操作中,后面 stage 的 task 想要去上一个 stage 的task 所在的 Executor 拉取数据,结果对方正在执行 GC,执行 GC 会导致 Executor 内所有的工作现场全部停止,比如 BlockManager、基于 netty 的网络通信等,这就会导致后面的 task拉取数据拉取了半天都没有拉取到,就会报出 shuffle file not found 的错误,而第二次再次执行就不会再出现这种错误。
# 调整 reduce 端拉取数据重试次数和 reduce 端拉取数据时间间隔这两个参数
val conf = new SparkConf()
 .set("spark.shuffle.io.maxRetries", "60")
 .set("spark.shuffle.io.retryWait", "60s")

12 故障:OOM

  • Shuffle map端:map 端缓冲的默认配置是 32KB,如果每个 task 处理 640KB 的数据,那么会发生 640/32 = 20 次溢写,如果每个 task 处理 64000KB 的数据,机会发生 64000/32=2000 此溢写,这对于性能的影响是非常严重的。
val conf = new SparkConf().set("spark.shuffle.file.buffer", "64")
  • shuffle reduce端: reduce task 的 buffer 缓冲区大小决定了 reduce task 每次能够缓冲的数据量,也就是每次能够拉取的数据量。reduce 端数据拉取缓冲区的大小可以通过 park.reducer.maxSizeInFlight 参数进行设置,默认为 48MB
val conf = new SparkConf().set("spark.reducer.maxSizeInFlight", "96")

13 Executor 堆外内存故障:OOM与task lost

  • Spark 作业处理的数据量非常大,达到几亿的数据量,此时运行 Spark作业会时不时地报错,例如 shuffle output file cannot find,executor lost,task lost,out of memory等,这可能是 Executor 的堆外内存不太够用,导致 Executor 在运行的过程中内存溢出。
  • Executor 的堆外内存主要用于程序的共享库、Perm Space、 线程 Stack 和一些 Memory mapping 等, 或者类 C 方式 allocate object。
  • stage 的 task 在运行的时候,可能要从一些 Executor 中去拉取 shuffle map output 文件,但是 Executor 可能已经由于内存溢出挂掉了,其关联的 BlockManager 也没有了,这就可能会报出 shuffle output file cannot find,executor lost,task lost,out of memory 等错误
# Executor 堆外内存的配置需要在 spark-submit :
--conf spark.yarn.executor.memoryOverhead=2048

14 spark数据倾斜

1. 数据倾斜的表现

  • Spark 作业的大部分 task 都执行迅速,只有有限的几个 task 执行的非常慢,此时可能出现了数据倾斜,作业可以运行,但是运行得非常慢;
  • Spark 作业的大部分 task 都执行迅速,但是有的 task 在运行过程中会突然报出 OOM,反复执行几次都在某一个 task 报出 OOM 错误,此时可能出现了数据倾斜,作业无法正常运行。

2. 定位数据倾斜问题

  • 查阅代码中的 shuffle 算子,例如 reduceByKey、countByKey、groupByKey、join 等算子,根据代码逻辑判断此处是否会出现数据倾斜;
  • 查看 Spark 作业的 log 文件,log 文件对于错误的记录会精确到代码的某一行,可以根据异常定位到的代码位置来明确错误发生在第几个 stage,对应的 shuffle 算子是哪一个;

3. 解决方法1 - 过滤产生数据倾斜的key

  • 在 Spark 作业中允许丢弃某些数据,那么可以考虑将可能导致数据倾斜的 key 进行过滤,滤除可能导致数据倾斜的 key 对应的数据

4. 解决方法2 - 聚合原始数据

  • 如果 Spark 作业的数据来源于 Hive 表,那么可以先在 Hive 表中对数据进行聚合,例如按照 key 进行分组,将同一 key 对应的所有 value 用一种特殊的格式拼接到一个字符串里去,一个 key 就只有一条数据了;之后,对一个 key 的所有 value 进行处理时,只需要进行 map 操作即可,无需再进行任何的 shuffle 操作。通过上述方式就避免了执行 shuffle 操作,也就不可能会发生任何的数据倾斜问题。

5. 解决方法3 - 提高 shuffle 操作中的 reduce 并行度

  • 在大部分的 shuffle 算子中,都可以传入一个并行度的设置参数,比如 reduceByKey(500),这个参数会决定 shuffle 过程中 reduce 端的并行度,在进行 shuffle 操作的时候,就会对应着创建指定数量的 reduce task。对于 Spark SQL 中的 shuffle 类语句,比如 group by、join 等,需要设置一个参数,即 spark.sql.shuffle.partitions,该参数代表了 shuffle read task 的并行度,该值默认是 200,对于很多场景来说都有点过小。

6. 解决方法4 - 聚合算子:使用随机 key 实现双重聚合

  • 首先,通过 map 算子给每个数据的 key 添加随机数前缀,对 key 进行打散,将原先一样的 key 变成不一样的 key,然后进行第一次聚合,这样就可以让原本被一个 task 处理的数据分散到多个 task 上去做局部聚合;随后,去除掉每个 key 的前缀,再次进行聚合。

7. 解决方法5 - join算子:将 reduce join 转换为 map join

  • 将较小 RDD 中的数据直接通过 collect 算子拉取到 Driver 端的内存中来,然后对其创建一个 Broadcast 变量;接着对另外一个 RDD 执行 map 类算子,在算子函数内,从 Broadcast 变量中获取较小 RDD 的全量数据,与当前 RDD 的每一条数据按照连接 key 进行比对,如果连接 key 相同的话,那么就将两个 RDD 的数据用你需要的方式连接起来。

8. 解决方法6 - join算子:sample 采样对倾斜 key 单独进行 join

  • 当数据量非常大时,可以考虑使用 sample 采样获取 10%的数据,然后分析这 10%的数据中哪个 key 可能会导致数据倾斜,然后将这个 key 对应的数据单独提取出来。

9. 解决方法7 - join算子:使用随机数扩容进行 join

  • 我们会将原先一样的 key 通过附加随机前缀变成不一样的 key,然后就可以将这些处理后的“不同 key”分散到多个 task 中去处理,而不是让一个 task 处理大量的相同 key。这一种方案是针对有大量倾斜 key 的情况,没法将部分 key 拆分出来进行单独处理,需要对整个RDD 进行数据扩容,对内存资源要求很高。

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