WRF 和 WPS 3.9.1 以及 wrf chem、wrf hydro安装

WRF 的安装其实没有什么难点，主要是依赖库比较繁琐，还有两个用的比较多的 chem 和 hydro，我在安装的时候在网上找的教程都不尽如人意，所以在这里总结一下

机器配置以及编译器选择

• intel 编译器 2013 版本，包含 mpiicc、mpiifort
• gcc 4.4.7

安装依赖库

    #安装依赖库 Zlib netCDF HDF5 Libpng Jasper
    #例如在local文件夹下
    $ mkdir Zlib netCDF HDF5 Libpng Jasper
    
    # 安装Zlib
    $ tar zxvf zlib-1.2.11.tar.gz
    $ cd zlib-1.2.11
    $ ./configure --prefix=/local/Zlib
    $ make && make install
    
    #安装HDF5
    $ tar zxvf hdf5-1.10.5.tar.gz
    $ cd hdf5-1.10.5
    $ ./configure --prefix=/local/HDF5 --enable-fortran --enable-fortran2003 
    
	#不过根据官方文档的说法，似乎两个选项同时存在的时候，只有--enable-fortran2003生效
    $ make
    $ make install
    
    #安装netCDF
    $ tar zxvf netcdf-4.1.3.tar.gz
    $ cd netcdf-4.1.3
    $ ./configure --prefix=/local/netCDF --disable-netcdf-4 --disable-shared --disable-dap CC=icc CXX=icpc FC=ifort F77=ifort
    $ make 
    $ make install
    
    #安装Libpng
    $ tar -zxvf libpng-1.2.12.tar.gz
    $ cd libpng-1.2.12
    $ ./configure --prefix=/local/Libpng CC=icc CXX=icpc F77=ifort
    $ make 
    $ make install
    
    #安装Jasper
    $ tar -zxvf jasper-1.701.0.tar.gz
    $ cd jasper-1.701.0
    $ ./configure --prefix=/local/Jasper CC=icc CXX=icpc F77=ifort
    $ make 
    $ make install

安装 WRF

 $ vim ~/.bashrc #添加以下内容
    
       #for netcdf
       export NETCDF=/local/netCDF
       export PATH=$NETCDF/bin:$PATH
       export LD_LIBRARY=$NETCDF/lib:$LD_LIBRARY_PATH
       export INCLUDE=${NETCDF}/include:$INCLUDE
   
       #for hdf5
       export HDF5=/local/HDF5
       export PATH=$PATH:$HDF5/bin
       export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$HDF5/lib
   
       #for zlib
       export ZLIB_HOME=/local/Zlib
       export LD_LIBRARY_PATH=$ZLIB_HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH
   
       #for libpng
       export LIBPNG_HOME=/local/Libpng
       export PATH=/local/Libpng/bin:$PATH
       export LD_LIBRARY_PATH=${LIBPNG_HOME}/lib:$LD_LIBRARY_PATH
       export MANPATH=${LIBPNG_HOME}/share/man:$MANPATH
       export LIBPNGLIB=${LIBPNG_HOME}/lib
       export LIBPNGINC=${LIBPNG_HOME}/include
       
       #for Jasper
       export JASPER_HOME=/local/Jasper
       export PATH=${JASPER_HOME}/bin:$PATH
       export LD_LIBRARY_PATH=${JASPER_HOME}/lib:$LD_LIBRARY_PATH
       export MANPATH=${JASPER_HOME}/share/man:$MANPATH
       export JASPERLIB=${JASPER_HOME}/lib
       export JASPERINC=${JASPER_HOME}/include

       
       #确保安装时文件使用无限制
       export WRF_EM_CORE=1
       ulimit -s unlimited
    
    #重新载入
    $ source ~/.bashrc

下面编译的 WRF 是普通版本，如果你想直接安装带有 chem 或 hydro 模块可以直接看最下面的教程

   #安装 WRF
    $ export PATH=${NETCDF}/bin:$PATH
    $ export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1
    $ tar zxvf WRFV3.8.1.TAR.gz
    $ cd WRFV3
    $ ./configure
        15
        1
    $ vim configure.wrf #修改以下内容
        DM_FC＝mpiifort
        DM_CC=mpiicc
    
    $ ./compile em_real -j 24
    $ ./compile wrf -j 24 # 24是代表你的机器cpu核心数

等待编译完成，在最后如出现 Executables successfully built，以及查看 main 文件夹下出现 4 个可执行 exe 文件就是安装成功

如果出现其他问题，可以自行上网搜索解决

安装 WPS

    $ cd WPS
    $ ./configure
        19
    $ vim configure.wps #修改以下内容
        COMPRESSION_LIBS    = -L/path/to/jasper/1.900.1/0/lib -L/path/to/other/lib -ljasper -lpng -lz
        COMPRESSION_INC     = -I/path/to/jasper/1.900.1/0/include
        DM_FC＝mpiifort
        DM_CC=mpiicc
    $ ./compile

看到有三个可执行文件 geogrid.exe metgrid.exe ungrib.exe 即可

安装 WRF chem

安装 flex-2.6.4

将 wrf-chem 解压到 WRFV3 文件夹中

export WRF_CHEM=1
export WRF_KPP=1
./compile -j 12 emi_conv

安装 wrf_hydro

下载 hydro 部分代码

下载地址

测试 wrf 3.9.1 使用 hydro 5.1.2 可以成功安装

安装

tar zxf wrf_hydro_nwm_public-5.1.2.tar.gz

# 保存一下原文件夹
mv hydro hydro_bak

# 将下载好的复制出来
cp -r wrf_hydro_nwm_public-5.1.2/trunk/NDHMS/ ./hydro

touch setEnvar.sh
vim setEnvar.sh

写入下面的内容，并保存

#!/bin/bash

# WRF-Hydro compile time options

# This is a WRF environment variable. Always set to 1=On for compiling WRF-Hydro.
export WRF_HYDRO=1

# Enhanced diagnostic output for debugging: 0=Off, 1=On.
export HYDRO_D=1

# Spatially distributed parameters for NoahMP: 0=Off, 1=On.
export SPATIAL_SOIL=1

# RAPID model: 0=Off, 1=On.
export WRF_HYDRO_RAPID=0

# Large netcdf file support: 0=Off, 1=On.
export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

# WCOSS file units: 0=Off, 1=On. 
export NCEP_WCOSS=0

# Streamflow nudging: 0=Off, 1=On.
export WRF_HYDRO_NUDGING=0

source 上面的文件，加载环境变量

source setEnvar.sh

cd hydro
./configure

# 选择 intel parallel
3

vim macros

# 修改编译器
COMPILER90=mpiifort

# 返回 WRFV3 文件夹重新编译主程序

cd ..
./clean
./compile wrf -j 24
./compile em_real -j 24 

安装成功后会在 hydro/Run 文件夹下会出现 wrf_hydro.exe，以及最后编译 wrf.exe 时会在最后一句编译命令处看到 -lHYDRO