hive中join导致的数据倾斜问题排查

hive中大key导致的join数据倾斜问题

1、场景

如果某个key下记录数远超其他key,在join或group的时候可能会导致某个reduce任务特别慢。本文分析下join的场景。
本例子SQL如下:查询每个appid打开的次数,需要排除掉作弊的imei。

selectappid,count(*)
from (
 
select md5imei,appid
 
from (
 
select  t1.md5imei,t1.appid,t2.cheat_flags
 
from  imei_open_app t1left outer joincheat_imei t2
 
on t1.md5imei=t2.md5imei
 )t3
 
where t3.cheat_flagsis null
) t4
group by appid ;

 
说明:表cheat_imei,7500万条,无大key,为作弊的imei。表imei_open_app,5亿6526万条,为每个imei打开的appid。该表中存在大key,md5imei=54bc0748b1c0fb46135d117b6d26885e的记录数有2亿3659万条。

2、Hadoop环境

hadoop 2.6.0-cdh5.8.0
hive-1.1.0-cdh5.8.0

3、导致的问题

可能会导致下面2个问题。

3.1 任务卡住

某个reduce task,卡在99.9%半天不动。如下
 
 

3.2 任务超时被杀掉。

Reduce task处理的数据量巨大,在做full gc的时候,stop the world。导致响应超时,超出默认的600秒,任务被杀掉。报错信息如下:

AttemptID:attempt_1498075186313_242232_r_000021_1 Timed outafter 600 secs Container killed by the ApplicationMaster. Container killed onrequest. Exit code is 143 Container exited with a non-zero exit code 143


4、如何判断是大key导致的问题

可以通过下面方法。

4.1 通过时间判断

如果某个reduce的时间比其他reduce时间长的多。(注意:如果每个reduce执行时间差不多,都特别长,则可能是reduce设置过少导致的)。如下图。大部分task在4分钟之内完成,只有r_000021这个task在33分钟内还没完成。

 

另外注意,这里面需要排除一种特殊情况。有时候,某个task执行的节点可能有问题,导致任务跑的特别慢。这个时候,mapreduce的推测执行,会重启一个任务。如果新的任务在很短时间内能完成,通常则是由于task执行节点问题导致的个别task慢。如果推测执行后的task执行任务也特别慢,那更能说明该task可能会有倾斜问题。

4.2 通过任务Counter判断

Counter会记录整个job以及每个task的统计信息。counter的url一般类似:

http://rm:9099/proxy/application_1498075186313_242232/mapreduce/taskcounters/task_1498075186313_242232_r_000017  

1)通过输入记录数

普通的task counter如下,


而task=000021的counter如下,其输入记录数是2亿4000万。是其他任务的10几倍


2)通过输出字符数

普通的task counter如下,


而task=000021的counter如下,是其他任务的几十倍


5、如何找到大key及对应SQL执行代码

5.1 找到对应大key

一般情况下,hive在做join的时候,会打印join的日志。我们通过日志查找大key。

1) 找到任务特别慢的那个task,打开对应日志,url类似于

http://rm:8042/node/containerlogs/container_e115_1498075186313_242232_01_000416/hdp-ads-audit/syslog/?start=0

2)搜索日志中出现的“rows for joinkey”,如下图。


 
 
3)找到时间跨度最长的那条记录,如下图。比如[54bc0748b1c0fb46135d117b6d26885e],处理的时间从2017-08-03 11:31:30 一直到2017-08-03 11:46:35,耗时15分钟,任务依然没有结束。
 
 
 
 
。。。。。。由于日志过长,中间部分省略。。。。。。。
 
 
另外,从日志中也可能看到,54bc0748b1c0fb46135d117b6d26885e已经处理了236528000条数据,实际情况是该key在imei_open_app中有2亿3659万条数据。该key为导致join倾斜的key。
 
 

5.2 确定任务卡住的stage

1) 通过jobname确定stage

一般通过Hive的默认jobname会带上名称会带上stage阶段,如下为Stage-1。


2)如果jobname是自定义的,那可能没法通过jobname判断stage。需要借助于任务日志。找到执行特别慢的那个task,搜索 “CommonJoinOperator: JOIN struct” 。Hive在做join的时候,会把join的key打印到日志中,如下。


上图中的关键信息是struct<_col1:string,_col6:string>

这时候,需要参考该SQL的执行计划。通过参考执行计划,可以断定该阶段为stage1阶段。


5.3 确定SQL执行代码

确定了执行阶段(即stage),那么通过执行计划,就可以判断出是执行哪段代码时出现了倾斜。还是从上图,可以推测出是在执行下面红框中代码时出现了数据倾斜。


6、解决方案

6.1 过滤掉脏数据

如果大key是无意义的脏数据,直接过滤掉。本场景中大key无实际意义,为脏数据,直接过滤掉。

6.2 数据预处理

数据做一下预处理,尽量保证join的时候,同一个key对应的记录不要有太多。

6.3 增加reduce个数

如果数据中出现了多个大key,增加reduce个数,可以让这些大key落到同一个reduce的概率小很多。

6.4 转换为mapjoin

如果两个表join的时候,一个表为小表,可以用mapjoin做。

6.5 大key单独处理

将大key和其他key分开处理,SQL如下

select appid,count(*)
from (
 select md5imei,appid
 from (
    select md5imei,appid,cheat_flags
    from select  md5imei,appid,t2.cheat_flags from  imei_open_app  where md5imei="54bc0748b1c0fb46135d117b6d26885e" ) t1
    left outer join cheat_imei  t2
    on t1.md5imei=t2.md5imei
    union all 
    select md5imei,appid,cheat_flags
    from select  md5imei,appid,t2.cheat_flags from  imei_open_app  where md5imei!="54bc0748b1c0fb46135d117b6d26885e" ) t11
    left outer join cheat_imei  t12
   on t11.md5imei=t12.md5imei
 )t3
 where t3.cheat_flags is null
) t4
group by  appid  ;

6.6 hive.optimize.skewjoin

会将一个join SQL 分为两个job。另外可以同时设置下hive.skewjoin.key,默认为10000。参考:

https://cwiki.apache.org/confluence/display/Hive/Configuration+Properties。但该

参数对full outer join无效。

6.7 调整内存设置

适用于那些由于内存超限内务被kill掉的场景。通过加大内存起码能让任务跑起来,不至于被杀掉。该参数不一定会降低任务执行时间。

如:

setmapreduce.reduce.memory.mb=5120 ;

setmapreduce.reduce.java.opts=-Xmx5000M  -XX:MaxPermSize=128m;


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