程序中使用了声明式事务管理，所有service中以add打头的配置是PROPAGATION_NOT_SUPPORTED，每个请求过来产生100个更新，当service处理完毕后，hibernate会把数据刷新到数据库，这个刷新的过程非常消耗时间。偶然间把事务的传播属性改成了PROPAGATION_REQUIRED，刷新到数据库的速度反而快了。暂时不知道为什么。。。
APPARENT DEADLOCK!!! 这个错误总是伴随着lock tables的发生，调整了mysql的connection数量，还有c3p0中的连接数量，都不好使，后来参考了http://blog.sina.com.cn/s/blog_5491164b0100sxtc.html中的做法，把hibernate.c3p0.max_statements 设置为0，问题暂时得到解决了。
调查的过程中发现，c3p0有未曾解决的bug。