笔者最近需要使用pyspark进行数据整理,于是乎给自己整理一份使用指南。pyspark.dataframe跟pandas的差别还是挺大的。
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1、-------- 查 --------
— 1.1 行元素查询操作 —
像SQL那样打印列表前20元素
show函数内可用int类型指定要打印的行数:
df.show() df.show(30)12
以树的形式打印概要
df.printSchema()1
获取头几行到本地:
list = df.head(3) # Example: [Row(a=1, b=1), Row(a=2, b=2), ... ...] list = df.take(5) # Example: [Row(a=1, b=1), Row(a=2, b=2), ... ...]12
查询总行数:
int_num = df.count()12
取别名
df.select(df.age.alias('age_value'),'name')1
查询某列为null的行:
from pyspark.sql.functions import isnull df = df.filter(isnull("col_a"))12
输出list类型,list中每个元素是Row类:
list = df.collect()1
注:此方法将所有数据全部导入到本地,返回一个Array对象
查询概况
df.describe().show()1
以及查询类型,之前是type,现在是df.printSchema()
root |-- user_pin: string (nullable = true) |-- a: string (nullable = true) |-- b: string (nullable = true) |-- c: string (nullable = true) |-- d: string (nullable = true) |-- e: string (nullable = true) ...12345678
如上图所示,只是打印出来。
去重set操作
data.select('columns').distinct().show()1
跟py中的set一样,可以distinct()一下去重,同时也可以.count()
计算剩余个数
随机抽样
随机抽样有两种方式,一种是在HIVE里面查数随机;另一种是在pyspark之中。
HIVE里面查数随机
sql = "select * from data order by rand() limit 2000"1
pyspark之中
sample = result.sample(False,0.5,0) # randomly select 50% of lines 1
— 1.2 列元素操作 —
获取Row元素的所有列名:
r = Row(age=11, name='Alice') print r.columns # ['age', 'name']12
选择一列或多列:select
df["age"] df.age df.select(“name”) df.select(df[‘name’], df[‘age’]+1) df.select(df.a, df.b, df.c) # 选择a、b、c三列 df.select(df["a"], df["b"], df["c"]) # 选择a、b、c三列123456
重载的select方法:
jdbcDF.select(jdbcDF( "id" ), jdbcDF( "id") + 1 ).show( false)1
会同时显示id列 + id + 1列
还可以用where按条件选择
jdbcDF .where("id = 1 or c1 = 'b'" ).show()1
— 1.3 排序 —
orderBy和sort:按指定字段排序,默认为升序
train.orderBy(train.Purchase.desc()).show(5) Output: +-------+----------+------+-----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ |User_ID|Product_ID|Gender| Age|Occupation|City_Category|Stay_In_Current_City_Years|Marital_Status|Product_Category_1|Product_Category_2|Product_Category_3|Purchase| +-------+----------+------+-----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ |1003160| P00052842| M|26-35| 17| C| 3| 0| 10| 15| null| 23961| |1002272| P00052842| M|26-35| 0| C| 1| 0| 10| 15| null| 23961| |1001474| P00052842| M|26-35| 4| A| 2| 1| 10| 15| null| 23961| |1005848| P00119342| M|51-55| 20| A| 0| 1| 10| 13| null| 23960| |1005596| P00117642| M|36-45| 12| B| 1| 0| 10| 16| null| 23960| +-------+----------+------+-----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ only showing top 5 rows123456789101112
按指定字段排序。加个-表示降序排序
— 1.4 抽样 —
sample是抽样函数
t1 = train.sample(False, 0.2, 42) t2 = train.sample(False, 0.2, 43) t1.count(),t2.count() Output: (109812, 109745)12345
withReplacement = True or False代表是否有放回。
fraction = x, where x = .5,代表抽取百分比
— 1.5 按条件筛选when / between —
when(condition, value1).otherwise(value2)
联合使用:
那么:当满足条件condition的指赋值为values1,不满足条件的则赋值为values2.
otherwise表示,不满足条件的情况下,应该赋值为啥。
demo1
>>> from pyspark.sql import functions as F >>> df.select(df.name, F.when(df.age > 4, 1).when(df.age < 3, -1).otherwise(0)).show() +-----+------------------------------------------------------------+ | name|CASE WHEN (age > 4) THEN 1 WHEN (age < 3) THEN -1 ELSE 0 END| +-----+------------------------------------------------------------+ |Alice| -1| | Bob| 1| +-----+------------------------------------------------------------+12345678
demo 2:多个when串联
df = df.withColumn('mod_val_test1',F.when(df['rand'] <= 0.35,1).when(df['rand'] <= 0.7, 2).otherwise(3))1
between(lowerBound, upperBound)
筛选出某个范围内的值,返回的是TRUE or FALSE
>>> df.select(df.name, df.age.between(2, 4)).show() +-----+---------------------------+ | name|((age >= 2) AND (age <= 4))| +-----+---------------------------+ |Alice| true| | Bob| false| +-----+---------------------------+1234567
选择dataframe中间的特定行数
而我使用的dataframe前两种方法都没法解决。特点如下:
特定列中的内容为字符串,并非数值,不能直接比较大小。
所选取数据为中间行,如第10~20行,不能用函数直接选取。
最终的解决方法如下:
首先添加行索引,然后选择特定区间内的行索引,从而选取特定中间行。
第一步,添加行索引。
from pyspark.sql.functions import monotonically_increasing_id dfWithIndex = df.withColumn(“id”,monotonically_increasing_id())123
第二步,筛选特定行。
dfWithIndex.select(dfWithIndex.name, dfWithIndex.id.between(50, 100)).show()1
2、-------- 增、改 --------
— 2.1 新建数据 —
有这么两种常规的新建数据方式:createDataFrame
、.toDF()
sqlContext.createDataFrame(pd.dataframe())1
是把pandas
的dataframe
转化为spark.dataframe
格式,所以可以作为两者的格式转化
from pyspark.sql import Row row = Row("spe_id", "InOther") x = ['x1','x2'] y = ['y1','y2'] new_df = sc.parallelize([row(x[i], y[i]) for i in range(2)]).toDF()12345
Row
代表的是该数据集的列名。
— 2.2 新增数据列 withColumn—
withColumn是通过添加或替换与现有列有相同的名字的列,返回一个新的DataFrame
result3.withColumn('label', 0)1
或者案例
train.withColumn('Purchase_new', train.Purchase /2.0).select('Purchase','Purchase_new').show(5) Output: +--------+------------+ |Purchase|Purchase_new| +--------+------------+ | 8370| 4185.0| | 15200| 7600.0| | 1422| 711.0| | 1057| 528.5| | 7969| 3984.5| +--------+------------+ only showing top 5 rows123456789101112
**报错:**AssertionError: col should be Column,一定要指定某现有列
有两种方式可以实现:
一种方式通过functions
from pyspark.sql import functions result3 = result3.withColumn('label', functions.lit(0))12
但是!! 如何新增一个特别List??(参考:王强的知乎回复)
python中的list不能直接添加到dataframe中,需要先将list转为新的dataframe,然后新的dataframe和老的dataframe进行join操作, 下面的例子会先新建一个dataframe,然后将list转为dataframe,然后将两者join起来。
from pyspark.sql.functions import lit df = sqlContext.createDataFrame( [(1, "a", 23.0), (3, "B", -23.0)], ("x1", "x2", "x3")) from pyspark.sql.functions import monotonically_increasing_id df = df.withColumn("id", monotonically_increasing_id()) df.show() +---+---+-----+---+ | x1| x2| x3| id| +---+---+-----+---+ | 1| a| 23.0| 0| | 3| B|-23.0| 1| +---+---+-----+---+ from pyspark.sql import Row l = ['jerry', 'tom'] row = Row("pid", "name") new_df = sc.parallelize([row(i, l[i]) for i in range(0,len(l))]).toDF() new_df.show() +---+-----+ |pid| name| +---+-----+ | 0|jerry| | 1| tom| +---+-----+ join_df = df.join(new_df, df.id==new_df.pid) join_df.show() +---+---+-----+---+---+-----+ | x1| x2| x3| id|pid| name| +---+---+-----+---+---+-----+ | 1| a| 23.0| 0| 0|jerry| | 3| B|-23.0| 1| 1| tom| +---+---+-----+---+---+-----+1234567891011121314151617181920212223242526272829303132
#####**坑啊!!!**其中,monotonically_increasing_id()
生成的ID保证是单调递增和唯一的,但不是连续的。
所以,有可能,单调到1-140000,到了第144848个,就变成一长串:8845648744563,所以千万要注意!!
另一种方式通过另一个已有变量:
result3 = result3.withColumn('label', df.result*0 )1
修改原有df[“xx”]列的所有值:
df = df.withColumn(“xx”, 1)1
修改列的类型(类型投射):
df = df.withColumn("year2", df["year1"].cast("Int"))1
修改列名
jdbcDF.withColumnRenamed( "id" , "idx" )1
— 2.3 过滤数据—
#####过滤数据(filter和where方法相同):
df = df.filter(df['age']>21) df = df.where(df['age']>21)12
多个条件jdbcDF .filter(“id = 1 or c1 = ‘b’” ).show()
#####对null或nan数据进行过滤:
from pyspark.sql.functions import isnan, isnull df = df.filter(isnull("a")) # 把a列里面数据为null的筛选出来(代表python的None类型) df = df.filter(isnan("a")) # 把a列里面数据为nan的筛选出来(Not a Number,非数字数据)123
新增-isin()
参考:
PySpark:使用isin过滤返回空数据框
[pyspark 实践汇总2](https://blog.csdn.net/yepeng2007fei/article/details/78874306)
有两个数据集,从data_1中抽取出data_2中的相同的元素
可行的方式: df_ori_part = df_ori[df_ori['user_pin'].isin(list(df_1['user_pin']))] df_ori_part = df_ori.filter(df_ori['user_pin'].isin(list(df_1['user_pin'])) == True ) 不可行: df_ori_part = df_ori.filter(~df_ori['user_pin'].isin(list(df_1['user_pin'])) )123456
3、-------- 合并 join / union --------
3.1 横向拼接rbind
result3 = result1.union(result2) jdbcDF.unionALL(jdbcDF.limit(1)) # unionALL12
— 3.2 Join根据条件 —
单字段Join
合并2个表的join方法:
df_join = df_left.join(df_right, df_left.key == df_right.key, "inner")1
其中,方法可以为:inner
, outer
, left_outer
, right_outer
, leftsemi
.
其中注意,一般需要改为:left_outer
多字段join
joinDF1.join(joinDF2, Seq("id", "name"))1
混合字段
joinDF1.join(joinDF2 , joinDF1("id" ) === joinDF2( "t1_id"))1
跟pandas 里面的left_on,right_on
— 3.2 求并集、交集 —
来看一个例子,先构造两个dataframe:
sentenceDataFrame = spark.createDataFrame(( (1, "asf"), (2, "2143"), (3, "rfds") )).toDF("label", "sentence") sentenceDataFrame.show() sentenceDataFrame1 = spark.createDataFrame(( (1, "asf"), (2, "2143"), (4, "f8934y") )).toDF("label", "sentence")123456789101112
# 差集 newDF = sentenceDataFrame1.select("sentence").subtract(sentenceDataFrame.select("sentence")) newDF.show() +--------+ |sentence| +--------+ | f8934y| +--------+123456789
# 交集 newDF = sentenceDataFrame1.select("sentence").intersect(sentenceDataFrame.select("sentence")) newDF.show() +--------+ |sentence| +--------+ | asf| | 2143| +--------+12345678910
# 并集 newDF = sentenceDataFrame1.select("sentence").union(sentenceDataFrame.select("sentence")) newDF.show() +--------+ |sentence| +--------+ | asf| | 2143| | f8934y| | asf| | 2143| | rfds| +--------+123456789101112131415
# 并集 + 去重 newDF = sentenceDataFrame1.select("sentence").union(sentenceDataFrame.select("sentence")).distinct() newDF.show() +--------+ |sentence| +--------+ | rfds| | asf| | 2143| | f8934y| +--------+123456789101112
— 3.3 分割:行转列 —
有时候需要根据某个字段内容进行分割,然后生成多行,这时可以使用explode方法
下面代码中,根据c3字段中的空格将字段内容进行分割,分割的内容存储在新的字段c3_中,如下所示
jdbcDF.explode( "c3" , "c3_" ){time: String => time.split( " " )}1
4 -------- 统计 --------
— 4.1 频数统计与筛选 ----
jdbcDF.stat.freqItems(Seq ("c1") , 0.3).show()1
根据c4字段,统计该字段值出现频率在30%以上的内容
— 4.2 分组统计—
交叉分析
train.crosstab('Age', 'Gender').show() Output: +----------+-----+------+ |Age_Gender| F| M| +----------+-----+------+ | 0-17| 5083| 10019| | 46-50|13199| 32502| | 18-25|24628| 75032| | 36-45|27170| 82843| | 55+| 5083| 16421| | 51-55| 9894| 28607| | 26-35|50752|168835| +----------+-----+------+12345678910111213
groupBy方法整合:
train.groupby('Age').agg({'Purchase': 'mean'}).show() Output: +-----+-----------------+ | Age| avg(Purchase)| +-----+-----------------+ |51-55|9534.808030960236| |46-50|9208.625697468327| | 0-17|8933.464640444974| |36-45|9331.350694917874| |26-35|9252.690632869888| | 55+|9336.280459449405| |18-25|9169.663606261289| +-----+-----------------+12345678910111213
另外一些demo:
df['x1'].groupby(df['x2']).count().reset_index(name='x1')1
分组汇总
train.groupby('Age').count().show() Output: +-----+------+ | Age| count| +-----+------+ |51-55| 38501| |46-50| 45701| | 0-17| 15102| |36-45|110013| |26-35|219587| | 55+| 21504| |18-25| 99660| +-----+------+12345678910111213
应用多个函数:
from pyspark.sql import functions df.groupBy(“A”).agg(functions.avg(“B”), functions.min(“B”), functions.max(“B”)).show()12
整合后GroupedData类型可用的方法(均返回DataFrame类型): avg(*cols) —— 计算每组中一列或多列的平均值 count() —— 计算每组中一共有多少行,返回DataFrame有2列,一列为分组的组名,另一列为行总数 max(*cols) —— 计算每组中一列或多列的最大值 mean(*cols) —— 计算每组中一列或多列的平均值 min(*cols) —— 计算每组中一列或多列的最小值 sum(*cols) —— 计算每组中一列或多列的总和1234567
— 4.3 apply 函数 —
将df的每一列应用函数f:
df.foreach(f) 或者 df.rdd.foreach(f)1
将df的每一块应用函数f:
df.foreachPartition(f) 或者 df.rdd.foreachPartition(f)1
---- 4.4 【Map和Reduce应用】返回类型seqRDDs ----
map函数应用
可以参考:Spark Python API函数学习:pyspark API(1)
train.select('User_ID').rdd.map(lambda x:(x,1)).take(5) Output: [(Row(User_ID=1000001), 1), (Row(User_ID=1000001), 1), (Row(User_ID=1000001), 1), (Row(User_ID=1000001), 1), (Row(User_ID=1000002), 1)]1234567
其中map在spark2.0就移除了,所以只能由rdd.调用。
data.select('col').rdd.map(lambda l: 1 if l in ['a','b'] else 0 ).collect() print(x.collect()) print(y.collect()) [1, 2, 3] [(1, 1), (2, 4), (3, 9)]1234567
还有一种方式mapPartitions
:
def _map_to_pandas(rdds): """ Needs to be here due to pickling issues """ return [pd.DataFrame(list(rdds))] data.rdd.mapPartitions(_map_to_pandas).collect()12345
返回的是list。
udf 函数应用
from pyspark.sql.functions import udf from pyspark.sql.types import StringType import datetime # 定义一个 udf 函数 def today(day): if day==None: return datetime.datetime.fromtimestamp(int(time.time())).strftime('%Y-%m-%d') else: return day # 返回类型为字符串类型 udfday = udf(today, StringType()) # 使用 df.withColumn('day', udfday(df.day))12345678910111213141516
有点类似apply,定义一个 udf 方法, 用来返回今天的日期(yyyy-MM-dd):
-------- 5、删除 --------
df.drop('age').collect() df.drop(df.age).collect()12
dropna函数:
df = df.na.drop() # 扔掉任何列包含na的行 df = df.dropna(subset=['col_name1', 'col_name2']) # 扔掉col1或col2中任一一列包含na的行123
ex:
train.dropna().count() Output: 166821123
填充NA包括fillna
train.fillna(-1).show(2) Output: +-------+----------+------+----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ |User_ID|Product_ID|Gender| Age|Occupation|City_Category|Stay_In_Current_City_Years|Marital_Status|Product_Category_1|Product_Category_2|Product_Category_3|Purchase| +-------+----------+------+----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ |1000001| P00069042| F|0-17| 10| A| 2| 0| 3| -1| -1| 8370| |1000001| P00248942| F|0-17| 10| A| 2| 0| 1| 6| 14| 15200| +-------+----------+------+----+----------+-------------+--------------------------+--------------+------------------+------------------+------------------+--------+ only showing top 2 rows123456789
-------- 6、去重 --------
6.1 distinct:返回一个不包含重复记录的DataFrame
返回当前DataFrame中不重复的Row记录。该方法和接下来的dropDuplicates()方法不传入指定字段时的结果相同。
示例:
jdbcDF.distinct()1
6.2 dropDuplicates:根据指定字段去重
根据指定字段去重。类似于select distinct a, b操作
示例:
train.select('Age','Gender').dropDuplicates().show() Output: +-----+------+ | Age|Gender| +-----+------+ |51-55| F| |51-55| M| |26-35| F| |26-35| M| |36-45| F| |36-45| M| |46-50| F| |46-50| M| | 55+| F| | 55+| M| |18-25| F| | 0-17| F| |18-25| M| | 0-17| M| +-----+------+123456789101112131415161718192021
-------- 7、 格式转换 --------
pandas-spark.dataframe互转
Pandas和Spark的DataFrame两者互相转换:
pandas_df = spark_df.toPandas() spark_df = sqlContext.createDataFrame(pandas_df)12
转化为pandas,但是该数据要读入内存,如果数据量大的话,很难跑得动
两者的异同:
Pyspark DataFrame是在分布式节点上运行一些数据操作,而pandas是不可能的;
Pyspark DataFrame的数据反映比较缓慢,没有Pandas那么及时反映;
Pyspark DataFrame的数据框是不可变的,不能任意添加列,只能通过合并进行;
pandas比Pyspark DataFrame有更多方便的操作以及很强大
转化为RDD
与Spark RDD的相互转换:
rdd_df = df.rdd df = rdd_df.toDF()12
-------- 8、SQL操作 --------
DataFrame注册成SQL的表:
df.createOrReplaceTempView("TBL1")1
进行SQL查询(返回DataFrame):
conf = SparkConf() ss = SparkSession.builder.appName("APP_NAME").config(conf=conf).getOrCreate() df = ss.sql(“SELECT name, age FROM TBL1 WHERE age >= 13 AND age <= 19″)1234
-------- 9、读写csv --------
在Python中,我们也可以使用SQLContext类中 load/save函数来读取和保存CSV文件:
from pyspark.sql import SQLContext sqlContext = SQLContext(sc) df = sqlContext.load(source="com.databricks.spark.csv", header="true", path = "cars.csv") df.select("year", "model").save("newcars.csv", "com.databricks.spark.csv",header="true")1234
其中,header代表是否显示表头。
其中主函数:
save(path=None, format=None, mode=None, partitionBy=None, **options)[source]1
Parameters:
path – the path in a Hadoop supported file system
format – the format used to save
mode –
specifies the behavior of the save operation when data already
exists.append: Append contents of this DataFrame to existing data.
overwrite: Overwrite existing data.
ignore: Silently ignore this operation if data already exists.
error (default case): Throw an exception if data already exists.
partitionBy – names of partitioning columns
options – all other string options
延伸一:去除两个表重复的内容
场景是要,依据B表与A表共有的内容,需要去除这部分共有的。
使用的逻辑是merge两张表,然后把匹配到的删除即可。
from pyspark.sql import functions def LeftDeleteRight(test_left,test_right,left_col = 'user_pin',right_col = 'user_pin'): print('right data process ...') columns_right = test_right.columns test_right = test_right.withColumn('user_pin_right', test_right[right_col]) test_right = test_right.withColumn('notDelete', functions.lit(0)) # 删除其余的 for col in columns_right: test_right = test_right.drop(col) # 合并 print('rbind left and right data ...') test_left = test_left.join(test_right, test_left[left_col] == test_right['user_pin_right'], "left") test_left = test_left.fillna(1) test_left = test_left.where('notDelete =1') # 去掉多余的字段 for col in ['user_pin_right','notDelete']: test_left = test_left.drop(col) return test_left %time test_left = LeftDeleteRight(test_b,test_a,left_col = 'user_pin',right_col = 'user_pin')1234567891011121314151617181920
延伸二:报错
Job aborted due to stage failure: Task 3 in stage 0.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 3.3 in12
解决方案
这里遇到的问题主要是因为数据源数据量过大,而机器的内存无法满足需求,导致长时间执行超时断开的情况,数据无法有效进行交互计算,因此有必要增加内存