从概念上看，C语言是一门面向过程、抽象化的通用程序设计语言;Java是一门面向对象编程语言，而Java语言是从C语言衍生而来，它吸收了C++语言的各种优点，并且摒弃了C++里难以理解的多继承、指针等概念。从概念可以看出C语言相当于Java的基础语言。
从应用领域上看，C语言和Java的应用领域几乎没有重合。因为随着这几年Java、web、PHP等语言的出现，它们凭借比C更简洁的、更安全的性能快速崛起，抢占了大量的市场。目前因为Java有完善的框架，在多线程、高并发方面有着较好的稳定性，所以Java主要应用于企业级应用开发、大型系统开发等领域。而C语言由于编程的复杂性，退守到了系统级别语言，而且因为想要系统级软件可以发挥出机器的功能，它的底层核心就需要用C/C++来编写，所以C语言主要应用于软件工业。
从语言本身来看的话，有这几点区别：
1、语法不同；
2、单文件的编译时间java比C语言快；
3、C语言可以直接操作内存，java不能直接操作；
4、C语言可以封装动态库，java不行；
5、C语言的代码不容易跨平台，java的代码容易跨平台；
6、C语言有指针，java没有指针；
7、C语言可以直接操作串口，java需要第三方jar包支持；
8、C语言的线程更加灵活，java的线程都已经封装好了；
9、C语言做单独功能，可以增加效率，java适用做web应用开发；
10、unix是C语言编写的，java也是C语言编写的；
11、JAVA做web开发的时候，已经有很多成型的框架技术，C语言很少，且需要处理底层内容，对应不熟悉计算机原理的开发者难度很大；
12、JAVA的开源包太多了，C语言也有但是偏少，而且面向某个业务应用领域的框架没java多；