原因分析：
默认条件下，应用(application)下的模块(module)的类装入器顺序是父类加载器优先，通过一层层向上查找，WAS引导程序扩展类装入器(com.ibm.ws.bootstrap.ExtClassLoader)在<WAS_HOME>AppServer/plugins/com.ibm.ws.runtime_6.1.0.jar中找到了org.apache.commons.logging包，由于此jar包中不含有commons-logging.properties文件，因此commons-logging采用默认的org.apache.commons.logging.impl.Jdk14Logger写日志。
解决办法：
(1)、企业应用程序 > "应用名" > 管理模块 > "war模块名", "类装入器顺序"选择"类已装入并且是先使用应用程序类装入器"
(2)、在commons-logging.properties中加入如下属性：
priority=0.1 # WebSphere自带的有一个的优先级为0.0的配置,将优先级设为高于0.0就可以不加载WebSphere自带的配置
