截止2018年1月11日，北京市共有自然保护区21个，从级别上来说，其中国家级自然保护区2个，市级自然保护区12个，区级自然保护区7个；从行政区域上来说，延庆区10个，密云区3个，门头沟区1个，平谷区1个，怀柔区2个，顺义区1个，房山区3个。（数据禾[databox.store]整理发布）
| 序号 |
自然保护区名称 |
行政区域 |
类型 |
占地面积（hm2） |
批准文号 |
批建 时间 |
主要保护对象 |
| 林业主管自然保护区 |
|||||||
| 1 |
松山国家级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
6212.96 |
市政府纪要[85]4期 |
1985.4 |
金雕等野生动物，天然油松林 |
| 2 |
百花山国家级自然保护区 |
门头沟区 |
森林生态系统 |
21743.10 |
市政府纪要[85]4期 |
1985.4 |
褐马鸡、兰科植物、落叶松等温带次生林 |
| 3 |
喇叭沟门市级自然保护区 |
怀柔区 |
森林生态系统 |
18482.50 |
市政府京政函[1999]147号 |
1999.12 |
天然次生林 |
| 4 |
野鸭湖市级湿地自然保护区 |
延庆区 |
湿地 |
6873 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
湿地、候鸟 |
| 5 |
云蒙山市级自然保护区 |
密云区 |
森林生态系统 |
4388 |
市政府京政函[2000]202号 |
1999.12 |
次生林 |
| 6 |
云峰山市级自然保护区 |
密云区 |
森林生态系统 |
2233 |
市政府京政函[2000]202号 |
2000.12 |
天然次生油松林 |
| 7 |
雾灵山市级自然保护区 |
密云区 |
森林生态系统 |
4152.40 |
市政府京政函[2000]202号 |
2000.12 |
珍稀动植物，天然次生林及典型森林生态系统 |
| 8 |
四座楼市级自然保护区 |
平谷区 |
森林生态系统 |
19997 |
市政府京政函[2002]107号 |
2002.12 |
天然次生林以及野大豆、黄檗、紫椴、刺五加等国家保护植物 |
| 9 |
玉渡山区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
9082.60 |
批建文件：市政府京政函[1999]168号 批准调整文件：市政府京政字[2017]15号 |
1999.12 |
森林与野生动植物 |
| 10 |
莲花山区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
1256.80 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
野生动植物 |
| 11 |
大滩区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
15432 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
天然次生林及野生动植物 |
| 12 |
金牛湖区级自然保护区 |
延庆区 |
湿地 |
1243.50 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
湿地 |
| 13 |
白河堡区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
7973.10 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
水源涵养林 |
| 14 |
太安山区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
3682.10 |
市政府京政函[1999]168号 |
1999.12 |
森林及野生动植物 |
| 15 |
水头区级自然保护区 |
延庆区 |
森林生态系统 |
1362.50 |
市政府京政字[2017]14号 |
2017.09 |
森林及野生动植物 |
| 16 |
蒲洼市级自然保护区 |
房山区 |
森林生态系统 |
5396.50 |
京政函［2005］17号 |
2005.4 |
森林群落及其生境所形成的森林生态系统 |
| 17 |
汉石桥市级湿地自然保护区 |
顺义区 |
湿地 |
1900 |
京政函［2005］17号 |
2005.4 |
湿地及候鸟 |
| 农业主管自然保护区 |
|||||||
| 18 |
拒马河市级水生野生动物自然保护区 |
房山区 |
湿地 |
1125 |
市政府93次常委会 |
1996.11 |
大鲵等水生野生动物 |
| 19 |
怀沙河怀九河市级水生野生动物自然保护区 |
怀柔区 |
湿地 |
111.20 |
市政府93次常委会 |
1996.11 |
大鲵、中华九刺鱼、鸳鸯等水生野生动物 |
| 国土主管自然保护区 |
|||||||
| 20 |
石花洞市级自然保护区 |
房山区 |
地质遗迹 |
3650 |
市政府京政函[2000]202号 |
2000.12 |
溶洞群 |
| 21 |
朝阳寺市级木化石自然保护区 |
延庆区 |
地质遗迹 |
2050 |
市政府京政函[2001]117号 |
2001.12 |
木化石 |
