GMT在Ubuntu环境下的安装流程及错误解决办法
本文借鉴博客地址：http://seisman.blog.ustc.edu.cn
GMT 采用UNIX 体系，把复杂的任务分解为较小和易处理的部分。单独的GMT 模块很小，容易维护，也能使用任何其他的UNIX 工具。 GMT 用ANSI C 程序语言写成（非常简便）, 适应于 POSIX 和Y2K，不受硬件（如内存）限制。GMT 有意用命令行形式写成，而不用Windows环境，以求最大程度的机动性。我们早就采用为标准化PostScript输出格式，而不用后文件（ meta–file）的形式。除了支持海岸线数据外，GMT完全decouples了由主GMT程序读取数据的操作。GMT 使用独立结构的文件格式。
GMT运行环境
1.安装GMT4.5.9所需要的文件
包括以下三个：
gmt-4.5.9.tar.bz2
gshhg-gmt-nc3-2.2.2.tar.gz
netcdf-3.6.3.tar.gz
把这些软件包放在同一个文件夹下面（下文称为安装文件夹），以便于操作。
下载地址：
http://gmt.soest.hawaii.edu/
(http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/netcdf-3_6_3/index.jsp)
注：你可能会看到gshhg-gmt-nc3-2.2.2.tar.gz和gshhg-gmt-nc4-2.2.2.tar.gz两个文件，其分别对应netcdf3和netcdf4，根据自己要安装的netcdf版本确定gshhg版本。
2.安装netcdf
tar -zxvf netcdf-3.6.3.tar.gz //解压netcdf
cd netcdf-3.6.3 //进入netcdf文件夹
./configure --prefix=/opt/netcdf-3.6.3 //configure, prefix指定netcdf的安装路径
make //编译netcdf
sudo make install //安装netcdf
3.安装GMT
cd .. //退回到netcdf上级目录
tar -jxvf gmt-4.5.9.tar.bz2 //解压GMT
cd GMT4.5.9 //进入GMT文件夹
./configure --prefix=/opt/GMT-4.5.9 --enable-netcdf=/opt/netcdf-3.6.3/
//配置GMT。prefix为GMT安装路径，--enable-netcdf为前面netcdf的安装路径
make gmt //编译GMT自己的可执行文件及库文件
make suppl //编译其他人提供的GMT扩展包及库文件
sudo make install-gmt //安装GMT自己的可执行文件
sudo make install-suppl //安装GMT扩展包
sudo make install-data //安装GMT数据，其实就是拷贝share目录
sudo make install-man //其实是拷贝man到share
sudo make install-doc //其实是拷贝doc到share
4.安装GMT所需要的海岸线数据
cd .. //返回GMT上级目录
tar -zxvf gshhg-gmt-nc3-2.2.2.tar.gz //解压GMT需要的海岸线数据
sudo cp -r gshhg-gmt-nc3-2.2.2 /opt/GMT-4.5.9/share/coast
//拷贝数据，将所有文件拷贝到share下的coast目录中
5.修改环境变量
export GMTHOME=/opt/GMT-4.5.9
export PATH=${GMTHOME}/bin:$PATH
修改主目录下的 .cshrc文件
添加：set path = ($path /opt/GMT/bin)
set path = ($path /opt/GMT)
保存，退出 （:x）
source .cshrc
输入:GMT，成功！
6.安装netcdf时在make的过程中错误
在刚安装的ubuntu系统中安装netcdf时在make的过程中会出现一些错误并退出，这个并不影响make install，其实主要是不影响GMT的安装和使用。
报错为：
gcc: error trying to exec 'cc1plus': execvp: 没有那个文件或目录
make[2]: *** [netcdf.lo] 错误 1
原因：未安装g++
解决办法：
sudo apt-get install g++
注意：可能需要保证gcc和g++的版本一致性
安装之后重新make就好
7.make错误2
make[2]: 正在进入目录 `/home/s2214/GMT/GMT4.5.6/src/xgrid'
gcc -O2 -Wall -fPIC -fno-strict-aliasing -I/home/s2214/GMT/GMT4.5.6/src -I/usr/local/netcdf/include -c -o xgrid_Panner.o xgrid_Panner.c
xgrid_Panner.c:4:31: error: X11/Xaw/Scrollbar.h: 没有那个文件或目录
可以看出大概的意思是X11下缺少了一些东西，所以导致xgrid无法编译通过。
可以通过在对GMT进行configure的时候关闭xgrid的编译选项，即configure命令改为：
./configure --prefix=/usr/local/GMT --enable-netcdf=/usr/local/netcdf --disable-xgrid
