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根据网上的教程来整合，发现如下问题：
无法访问android.app.Activity
找不到android.app.Activity的类文件
网上看到大牛说是这个原因：无法访问android.app.Activity是说明没有引入android.jar包
可以看看java -h里面的具体说明。
其中有一个-bootclasspath参数 让他指向android.jar包
以下举个例子：javah -classpath bin/classes -bootclasspath D:\Environment\android-sdk-windows\android-sdk-windows\platforms\android-16\android.jar -d jni com.jm.promedia.SecondActivity
或者也可以到src目录下 javah -d ../jni com.jm.promedia.SecondActivity
其中-d是建立一个目录，把生成文件放进去
这就可以看出来问题很简单，android的jar包找不到，大牛说了这样一句：“ 或者也可以到src目录下 javah -d ../jni com.jm.promedia.SecondActivity ”
于是，ubuntu14下整合eclipse和javah生成jni头文件也可以这样设置
参照另一个大牛的教程：http://blog.csdn.net/jiuyueguang/article/details/9404237
Working Directory和Arguments的设置改成我这样的就可以了，图片如下：
接下来就可以了，如有问题可以qq联系我，QQ：1024883177