对于博士/科研工作者来说，文献阅读量当然是越大越好，特别是在研究初期。但文献一多，如何有效的管理它就成了问题。据不完全统计，目前市面上的文献管理软件至少有几十种，其中主流的有：Endnote、Mendeley、Zotero、Papers等。（我曾推送过几篇关于文献检索及阅读文献的方法，会贴在文章的结尾处）
文献管理软件那么多，哪一款才是适合我的？
下面，我们就来分析一下常见的四款文献管理软件：
Papers
用Papers管理Papers
Papers是一款便于写论文的PDF整理工具，它的主要功能包括文献导入、组织、阅读（注释）、自动匹配参考条目，搜索、在文档中插入引用、评点交流等。
以下图示为Papers 3，图源知乎
优点
◆支持很多主流文献数据库搜索，如arXiv，Google Scholar。
◆支持PDF抓取文献信息，能自动识别如标题、作者、年代等信息，分类简洁明了。
◆阅读模式下，可以标注和笔记，并能根据文献的重要程度进行评级。
◆支持与iPhone/iPad互联，可以通过云盘方式实现文献多终端阅读。官方推荐云盘是Dropbox（国内无法使用），除此以外还支持：Box、Google Drive、iCloud、OneDrive、OneDrive、SugarSync、Network。
◆通过弹出窗口的模式与Word结合，可实现参考文献插入功能。
◆可以创建Shared Collection，生成对应URL与朋友分享文献。
缺点
◆收费。
◆几乎无法识别中文文献、专利文献、专业书籍的PDF。
◆部分年代较为久远的文献无法识别。
◆由于国内对谷歌的封锁，因此谷歌学术无法实现搜索。
◆分享文献的功能在国内用起来不方便，Chrome浏览器无法打开应用商店，Dropbox也不是很好用。
Endnote
价格对得起出身的老牌软件
EndNote是SCI（Thomson Scientific公司）的官方软件，支持国际期刊的参考文献格式3776种，写作模板几百种，涵盖各个领域的杂志，提供桌面版和网络版。如果需要编写SCI稿件，那么采用此软件会更方便。
优点
◆系统资源占用小，功能扩展性强，能管理的数据库没有上限。
◆三大优势功能：
①提供Word插件，支持边写论文边插入参考文献并调整顺序或删除，编号也会及时更新，如分章节插入参考文献和新建/修改参考文献导出的格式；
②个人文献管理很清晰，如导入PDF后，Endnote会自动获取文献信息并进行排版，更新题录，有很多杂志的模板可以参考；
③内嵌多种数据库，可在软件内进行文献检索（少数数据库需要账户密码才能连接）；
◆在PDF全文显示窗口中支持自由标记高亮字句，并可添加注释。
◆桌面数据可同步至网络版，更新个人数据库比较方便。
◆杂志题录样式相较于其他软件来说更齐全，存储空间无限，并可与其他人分享题录。
◆可以直接在软件内搜索WOS等数据库文献记录并批量下载PDF。
缺点
◆收费，网上有破解版，不过破解版的Bug比较多。
◆不支持全文搜索，且无法直接拖拽PDF文件或文件夹到软件中。
◆PDF文件重命名最大支持40个字符，而大多时候字符都会超出。
◆如果文件名超长在备份时就会容易出现文件丢失问题，但改成短文件名则几乎不会出现该问题。
◆几乎没有参考文献记录解析能力。
◆有Label功能，但只能在排序窗口的中间位置显示Label结果，且不能选择不同Tag，也不能及时在窗口显示，需要时常保存。
◆缺少跨平台实时同步，运行不是非常流畅。
Mendeley
免费学术文献交流平台
Mendeley是一款免费的跨平台文献管理软件，同时也是一个在线的学术社交网络平台，可一键抓取网页上的文献信息添加到个人图书馆中。对比如Endnote类的传统文献管理软件来说，它的显著优势是免费，比较适合本地操作和大量PDF的文件管理。
优点
◆免费，可跨平台管理。
◆提供MS Word和Open Office插件，方便在文字编辑器中插入和管理参考文献。
◆免费提供各2GB的文献存储和100MB的共享空间。
◆支持全文搜索，可直接拖拽PDF文件或文件夹到软件中，只要能识别PDF中的DOI，就可通过DOI在线获取文献的准确信息。
◆PDF文件重命名无字符数限制。
◆免费Tag功能，批量管理，支持免费云同步，支持推荐相关参考文献。
◆社区功能强大，适合喜欢与同行交流的人。
◆分类功能机对文献物理存储的自定义相对较好，可以自动提取标题及作者。
◆支持Windows，Mac，Linux。
缺点
◆不能自定义文献类型，给文献管理和参考文献的插入带来了很多麻烦。
◆开启Word拼写检查功能并用Mendeley在文档中插入很多参考文献时，Word程序会宕机。
◆虽然Mendeley更新频繁，但也意味着程序会变的十分不稳定，在进行某些特定操作时会崩溃。
◆文献检索的搜索逻辑不太人性化。
◆访问Mendeley在线服务速度比较慢，尤其体现在：①不能方便查阅软件使用手册和FAQ；②与云服务器的同步速度较慢；③不能方便地访问Mendeley社区网站。
这里放一张Docear、Zotero、Mendeley的对比图，补充本文未提到的另两款文献管理软件。
图源：《Comprehensive Comparison of Reference managers:Mendeley vs. Zotero Vs. Docear》
ReadCube
简洁、统一的用户体验
Readcube是Labtiva公司研发的第一款软件，作为一个文献管理整合平台，它力求改变人们脑中固有的、传统的文献检索方式。
优点
◆界面优美，功能较全，基础版免费。
◆对于搜集到的文献，勤于整理不会积压：有价值的保留，无价值的舍弃，对保留的文献建立主题属性、文章属性等的标签云。
◆支持直接拖拽PDF，且可以对在PDF内创建的批注进行检索。
◆支持自动识别PDF文献中最后的被引文献，并把这个被引文献列表放在阅读器的右边，当想要阅读哪条被引文献时，就无需来回滚动。
◆自带搜索引擎及Pubmed、Google Scholar。
◆支持将PDF文件按照年份、期刊、作者、标题分到不同的子文件夹中。
缺点
◆Tag功能专业版才有，且和云同步一样要收费
◆对参考文献的解析能力不如Mendeley
◆Readcube的PDF注释不是嵌入PDF文件内的，不太适合喜欢对PDF加注释的人
◆导入本地的PDF偶尔会无法准确识别，需要手动修改。
图源：知乎，作者三生无尾
图源网络，出处不明
最后，由于篇幅限制，想了解更多文献管理软件间不同点的读者们，可以去以下地址：
https://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software