Linux下使用crontab定时激活conda虚拟python环境

• 今天需要弄一个linux下的定时任务，考虑到用crontab去写，但是遇到很多问题，主要就是怎样在crontab的定时脚本中激活conda的环境，至于为什么这样做，接下来介绍一下背景

• 我们要运行的python脚本事先用setup打包成了一个包，然后利用click库，将要运行的函数添加到了命令行。也就是说，只要我安装了这个包，只需要运行一条我们规定的shell命令就好了，就不需要额外其他的python脚本。

• 于是，安装了包，解决了一堆路径依赖问题后，终于，输入命令行可以运行了，接下来就该设置定时任务了，这时候就发现一个操蛋的问题了。我们的这个包是在python2环境下的，每次运行前都要用 source activate python2(随便起的) 来激活环境再运行呀，但是我并没有在脚本里试过这种命令。想着反正shell脚本里都是shell语句，写着试一试吧。

• 版本一：
  假设我们的shell的脚本文件命名为(task.sh)， 先试着运行sh task.sh 没有反应.

#!/bin/sh
source activate python2

于是上网查了一下，在一篇博客中发现，如果想要在shell脚本中运行激活conda环境，不能使用sh，要使用source。也就是使用命令行 source task.h 来运行脚本。尝试之后，conda的python2环境成功被激活。

• 版本二:
  于是 task.sh 保持不变，将crontab的设置修改如下：就是每周一到周五5:10时运行脚本，激活环境

10 5 * * 1-5 source /home/task.h

结果发现，虽然直接运行source /home/task.h是可以激活环境的，但是在crontab的定时任务中就是没有办法成功。

• 在查阅了许久的博客，想了许多的办法之后，想到去看一下crontab的日志吧。为什么不是一出问题就去看日志，因为我之前就没找到我这个服务器的cron日志啊，但是这次实在是没办法了，死马当活马医吧。至于后来怎么找到日志的，文末再讲。
• 在跟踪到cron的日志后，发现了在运行 source activate python2 这一句时，出现了报错：source: activate: file not found. 思索了一会之后，我突然明白了两个事情：

1. source activate python2在激活环境时，本质上是通过运行activate这个文件实现的，只不过是在安装conda的时候把它添加到了环境变量，搞得我一直以为这是个怎么都可以用的shell命令行。
2. 由于cron在定时运行脚本时，没有指定目录，所以最好使用绝对路径。

• 想到这里我立马找了一下activate的位置，路径是在/miniconda3/bin/activate ， 这样，终于出来可以用的版本三。
• 版本三：
  分别将 task.sh 和crontab修改如下：这样，成功利用cron定时脚本激活conda环境

#!/bin/sh
source /miniconda3/bin/activate ctp_task

!!!以上是shell脚本task.sh,以下是crontab的内容  

10 5 * * 1-5 sh /home/task.h

• 最后一个问题，怎样找到的cron日志。这个其实我真的也是没有办法呀。去网上搜索cron日志在哪里，找到一个路径，就去看一看有没有。没有的话就接着搜博客，看看其他的博客提出的不同的路径，最后终于在/var/spool/mail路径下找到了各个用户cron的日志。（PS:我的系统是Linux的opensuse版本）。最后使用tail -f命令追踪日志，发现了问题。

这小半天，就浪费在这个上了，终于解决了，心情有点爽！