使用 git rm 命令即可，有两种选择,
一种是 git rm --cached "文件路径"，不删除物理文件，仅将该文件从缓存中删除；
一种是 git rm --f "文件路径"，不仅将该文件从缓存中删除，还会将物理文件删除（不会回收到垃圾桶）。
2016.0528.0904 更新：
[其他] 请问 git rm --cache 和 git reset HEAD 的区别到底在哪里呢？
如果要删除文件，最好用 git rm file_name，而不应该直接在工作区直接 rm file_name。
如果一个文件已经add到暂存区，还没有 commit，此时如果不想要这个文件了，有两种方法：
1，用版本库内容清空暂存区，git reset HEAD
2，只把特定文件从暂存区删除，git rm --cached xxx
PS：再次亲测，git rm --cached xxx 并没有问题；慎重使用 git reset HEAD
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创建目录 mkdir
创建文件 touch
http://linux.ctocio.com.cn/228/9355228.shtml
linux 删除目录很简单，很多人还是习惯用 rmdir，不过一旦目录非空，就陷入深深的苦恼之中……
直接 rm 就可以了，不过要加两个参数-rf即：
rm -rf “目录名字”
-r 就是向下递归，不管有多少级目录，一并删除
-f 就是直接强行删除，不作任何提示的意思
需要提醒的是：使用这个 rm -rf 的时候一定要格外小心，linux 没有回收站的