更新说明：对于新版本的ADT（具体版本不记得了，总之，现在下载的ADT都有），google已经提供了直接配置调用ndk-build的功能，下面的内容已经没有必要了。只需要在工程上右键，选择Android Tools，然后add native supoprt即可）
对于NDK的编译，切换到目标目录下，运行ndk-build脚本即可。
对于使用Eclipse开发，我们希望EC能自动的编译我们的NDK，那么只需要为工程添加一个Builders即可。
对于Windows的开发，如果使用的NDK是r7之前的版本，必须要安装Cygwin才能使用NDK，所以为EC需要配置的builder，其实是执行Cygwin，然后传递ndk-build作为参数。在NDKr7开始，Google的Windows版的NDK提供了一个ndk-build.cmd的脚本，这样，就可以直接利用这个脚本编译，而不需要使用Cygwin了。所以，windows和Linux上都可以类似的使用系统命令行直接进行NDK编译。
既然NDKr7来了，至于Cygwin的配置，就不说了。下面是使用NDKr7在windows下配置自动编译的builders的过程，对于Linux，只需要修改ndk-build.cmd为ndk-build即可了。
（1）测试准备：新建一个Eclipse工程，在工程目录下新建jni文件夹，其中写好必要的NDK编译的文件代码等。
（2）Project->Properties->Builders->New，新建一个Builder。
（3）在新建Builder中进行如下配置：
其中，Location为ndk-build.cmd的路径（PS：NDK的安装只需要解压到某一路径即可）。
Working Directory，为当前的工程下。这里的${}的表达是使用了EC的环境变量，可以使用Variables...按钮找到一些EC的环境变量。
对于Linux上的配置，和这里的配置一样，只是把Location的地址改为ndk-build即可。
（4）下面是Refresh选项卡和Build Options选项卡的配置：
其中，在配置Build Options的时候，点击Specify Resources按钮，选中工程下的jni文件夹如下：
这样，EC就能自动调用NDK脚本编译jni下的C/C++代码了。