BLAST(基本局部比对工具)

nucletide blast blastn 短序列标准搜索
megablast 相似序列(单物种)之间比对
discontiguous megablast 跨物种序列比对
protein blast blasp 标准搜索
psi-blast 使用blastp搜索结果构建位置特异性得分矩阵(PSSM)
phi-blast 发现具有相同表达模型且相似的蛋白质序列
blastx 核酸序列转换成蛋白质序列搜索
tblastn 蛋白质序列转换成核酸序列搜索
tblastx 核酸序列转换成蛋白质序列,在将核酸数据库转换成的蛋白质数据库中搜索

对GenBank中人类VANGL2基因的mRNA进行比对搜索。

输入:
RefSeq检索号NM_020335
Job Title:任务名称
Database:核酸数据库检索
Optimize for:程序选择,简单的blastn即可
Expect threshold:期望值,越小越严格

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等待:在这里插入图片描述
结果:
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